EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40022 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:5087143-5088364 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:5088204-5088223CGGCGCCCCCCGCTGGACA-6.35
NFYAMA0060.3chr3:5087411-5087422AACCAATCAGA+6.62
PBX1MA0070.1chr3:5087497-5087509AATGATTGATGG-6.07
POU1F1MA0784.1chr3:5087430-5087444CTCATTTGCATATT-7.82
POU2F1MA0785.1chr3:5087432-5087444CATTTGCATATT-6.74
POU2F2MA0507.1chr3:5087430-5087443CTCATTTGCATAT+7.52
POU3F1MA0786.1chr3:5087431-5087443TCATTTGCATAT-6.18
POU3F2MA0787.1chr3:5087431-5087443TCATTTGCATAT-6.37
POU3F3MA0788.1chr3:5087431-5087444TCATTTGCATATT-6.02
POU5F1MA1115.1chr3:5087432-5087443CATTTGCATAT-6.32
Pou2f3MA0627.1chr3:5087429-5087445GCTCATTTGCATATTC-6.15
TEAD2MA1121.1chr3:5087465-5087478GGCTGGAATGTGT-7.34
Enhancer Sequence
CATTCTCCAG AAGACCTGAA AACACTTTAA CACACACTCT TTAACCATTT CTCCTGCTCA 60
AGCTGTGCTC CTGACACCAC TGTCAGCACT CTCTGAGCTC TGCTGTTGTT GTTTTAATGC 120
TAAGCTGTGG ACACAAGGTC AACCTGAATG ATGTGAAGCC TTTAAAGGGT GAAAATGTTA 180
GACTTTTCAG ACTATTATTT CATCAGTCAA GCTTAACTGA GCTCATCTAT TTAACAAACA 240
GCACATCTGA GCCAGAGAGC ATTTCATCAA CCAATCAGAA GCCGGTGCTC ATTTGCATAT 300
TCAGTATTAC TGACGTCATA TTGGCTGGAA TGTGTTGAGA GGGCGGAGTT TTGAAATGAT 360
TGATGGCTGA GGTCAGAGAA GGAGTTAAAT AATAGCTGCT ATACTCCTGA ACATCGTCTC 420
TTGTTGTCTT CAGGCATCCT AAATGACCCT TTAGCAGACA GATCTTGCGC TGAAGTCAGT 480
GTGAAATGAT CCAGACTGTC TGTACCCGTG TTAGATCAGT GTGTGTGTGT GAATAAAAGT 540
GTCTGTCTGT CCATCCTGAA GGGGGTTTGA TCAGCTTTGA CATCTTCCCG GAGGGCTGGG 600
ACAAACGCCT CTGTCTGGAC GTCCTGGAGC AGGAGGGACT GGACACCATC TACTTCTTTG 660
GCAATGAAAC CTCACTGGTG AGTGAGTGAA TGCGAGTCTG TATCAATGTG ACTTCGGTTT 720
TCATTCATTT TTAATCAACT TTACGGACTT GTACATTTGA TTGTGTGTGT GTTTGTTTTG 780
TGCGTATGTG TGCGTTTGCT TTGCTCTCTC ATGTTCACTG TTAAACCTGC CATTGAAAGG 840
CTTAATAATA AAGAAGGACG AGTTCAGAAG TGTGTTTAGT GTGTAGAAGT GCACAATTTT 900
TCCATTTCTT CTTCTTCCCC TGATCAGGGT GGAAACGACT ACGAGATCTT CGAGGATCCT 960
CGCACCGTGG GCTTCAGCGT CTCCTGTCCC GCAGACACAG CGCGGCTCTG CAGAGAGATG 1020
TTCTTCAGCG CTCCTCCAAA TGAAGATTGA TCAAGACTCT CCGGCGCCCC CCGCTGGACA 1080
ATACAGGACA CTACCGGTGG GAAACACACA TTGACTCAAT ACAACAAACA CAGATGAAGA 1140
CACAGACTGT ATGGAGACAT CACAAACAGA CTGACCTTAC AGCTTTATAG TGTCCACGCA 1200
TTCAGGGTCA TTACCGTAAG C 1221