EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40003 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:3409241-3410110 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr3:3409335-3409346TTTTATTGCTT-6.32
HOXD9MA0913.2chr3:3409334-3409344GTTTTATTGC-6.02
RFX5MA0510.2chr3:3409939-3409955CGTTGCCATAGCAGCA-6.14
RFX5MA0510.2chr3:3409939-3409955CGTTGCCATAGCAGCA+6.1
Sox1MA0870.1chr3:3409310-3409325CACAATTTCATTGTG+6.61
Enhancer Sequence
TCACGTTGTT AATCTTTTCT ATTTTTGTCC GGAAAGAATA GATTAGAGGG AACAAAAGTT 60
TTGTTACTGC ACAATTTCAT TGTGGTACCA TTTGTTTTAT TGCTTGACTG CATTTAGTGT 120
TGTTAAGAAA GTAAAACTTC ATTTAAGTTG TCCGCTGAGA CAAACTGTAA GCCGCTCTAA 180
AGCGCATGTA GAGAAAGACA AAGCGTATTC CTTTGTGCTT ATCTCATAAC GTTATATAAG 240
GCCTTCACAG TATGATTTCG TACGCCGCGA TTCCCGGATG GAAACTCAAC TGTGTTTTCT 300
CCTGGTAACT GATTTAGCAT AGCTAACTAA ATTCTTGTTG CCCTGTAATT TGCTAAGACT 360
TAGTGAAGTA TTTAAAACGC GGAGCTCAGA GAGAGCTGCC TAGCGTAGTT TATAGGAGAA 420
GTTTTGAAAT TGATCAATTG AAATTGTGGT TTGAATCCAC GGATGTGTTT GCAGTCTACA 480
CAGACTTAAC ACAGAGTGCT GAGATCCCCC ATATCTCTGT CACGATTTGT ATTAATCTCA 540
GAAATCCTGT TGATTAATTT TGTCTCACTT TCATAAGTTG AGAATCGTTC AGTACTGTTA 600
AGATATAAAA TCTAACTAGT GCTTTTTGCT TGAACAGTGT GAGATGCGCC GCCATCTCAA 660
GTGATACTGT GAAATTTGCT ATTATTCCAC TTTGTGGTCG TTGCCATAGC AGCAACCTTG 720
GTCCGGAAGT ACAGAGAGAC TTGCCGGAAT TACATTCAAG CGCGCATGTG CAGTCCGCCA 780
GCGCCAGCTT GAATTGTAAA CAAAGAGCAT AGCGTGAAGC TAAGCTAAAC TAACGCTAAC 840
GCGTTTGCAT TGAAGTCTAT GCATTTCCA 869