EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-39771 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr25:34108829-34109619 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr25:34109571-34109583CAGCATATGTTT-6.04
RFX1MA0509.2chr25:34109287-34109303TGTCACTATGGCAACC+6.05
RFX1MA0509.2chr25:34109287-34109303TGTCACTATGGCAACC-6.05
RFX2MA0600.2chr25:34109287-34109303TGTCACTATGGCAACC+6.21
RFX2MA0600.2chr25:34109287-34109303TGTCACTATGGCAACC-6.39
RFX3MA0798.1chr25:34109287-34109303TGTCACTATGGCAACC+6.31
RFX3MA0798.1chr25:34109287-34109303TGTCACTATGGCAACC-6.36
RFX4MA0799.1chr25:34109287-34109303TGTCACTATGGCAACC+6.25
RFX5MA0510.2chr25:34109287-34109303TGTCACTATGGCAACC+6.21
RFX5MA0510.2chr25:34109287-34109303TGTCACTATGGCAACC-6.28
TP53MA0106.3chr25:34109088-34109106GACTTGCCTCGACATGCC+6.14
TP53MA0106.3chr25:34109088-34109106GACTTGCCTCGACATGCC-6.43
Enhancer Sequence
CACTGGAAGT ATGCGGTGAT GTGGTAAGAC ACGGGTGCGT CCCTGATACT GCCACTTTGT 60
TATGACTGAC AGTAAAAGCA ATCAATTGTG CACTTTGAGG AAGACAAAGA CTTCTGGGCG 120
AGATTAGCGA CTCTGAAGTT CATAACAGTC TCTCGAGTGT CAGTTTTGAC ATCCAACACT 180
TTTATACAAG GTTGACTAGT TGAACTAGAG CCGCGGGTTC AGATCCTCGG GTCTCTAAAA 240
AGCTCTGCTG GGAGAAATCG ACTTGCCTCG ACATGCCCTG ACTGGCTCAG TGTTAGGTTT 300
TCCTTTCTCT CAGTATTCAT CATCCCAGCT TGTGTAAATG TAAATGTTGA CCCAAACATG 360
GTAAATGTGA TTGAATGCAT GAAATCCGCC TCCAAACACA TGTGCAGAGG GCAAAGTGCG 420
GAAACGCACA CTCTTTTGTG CCAGCTGGGC CTGTTGTCTG TCACTATGGC AACCAGGTGG 480
GGCTGTCAGC TTCCAGGTTG CACCGACACC TGCTGCATTA TTTATCTCTG GCTGTAACCC 540
GACTACATGG GAACTAATAT CCCTCGACGC TGGTCTGTAA GGTTACTTTA AACCCACCAC 600
TTCTTTCATT GGATCACTGC ATGCTTTGCT TTTGCCTTTT TACCCTTATT AGGGCACCTG 660
GAGTGTCTCG CATTCATTTT CCTTCAGCTT GGTGCCTTTA TTCATCATGG GTCACCACAG 720
AGGAAGGAAC CGGCAACTAT TCCAGCATAT GTTTTTTACA TTGCATATTC CCTTCCAGCA 780
GCAACCCAGT 790