EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-39484 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr25:28479040-28480648 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRTA2MA1478.1chr25:28480274-28480286AAATGTTACATT+6.52
RUNX3MA0684.1chr25:28480409-28480419TTTGCGGTTT-6.02
TBR1MA0802.1chr25:28480229-28480239TTTCACACCT-6.02
Enhancer Sequence
GGCATCTTCA GCAGTTTAAA TGAAGCCTTG TCATCGCTAA AGTCAACATT TTCTCTTTAT 60
TTCAAATATA TAACCAGCCC AAACAAATGT AATTCACCAA AATGTTTGAC ACACACACAT 120
AGCCTGTACT GTGCCACTGA CACACTGATT TGATAACTGT GACAAAGTGA AAACATAGGC 180
TGGTGTCATT TCGAAATGAC AAAAGAACAC AGACCGTGGT AAAAACAACA CATGAAATAA 240
AACACAAACG GCTCGCGATT AGAATGAACA GCAAATCAGC CAGCAGAGTA TCAGTAACAG 300
ACTTTTATTG GTCATTTTTG TAAATTGCAC GACTTTCATA CCTGTTAAGT TTCATGCCAG 360
TACTCTGGTT TTCTCTCTCT CTCGCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCA CTTTCTCACT 420
CTCTCTCTCT CTCTCTCTGT GTGCGTTAAA GAGCCGCTGA GCTAACAGCT GACAGGCCGG 480
AAACGCACGC ACACACACAC GGTATTTCTG ACTGCAGACA CGTGAACTTG GAGAACGTTT 540
TTCTCGTATT TCTGACGCGT TGAACCACAT GTGACAGATT ATAACGGCTT TAACAAACAC 600
ATTTCTAAGT TGTGTGCTCA CAAAAACACT CTGTTATCCA TTAAAAACGT TATTGAAACC 660
CATTTTCGGA GCGCAAATTA CCAGTTGTAC ACGCTGTAAA CAGAAGTTTT TAGCATTCTA 720
CCGGAAGACG CTGGTCGCTA TGGCGCCCTC CATGCAGCAG CCATAAAAAA GGTCTACAGC 780
ATGCCAGTGG TGGTAAATCG CAACTTAAAA TATGTTTTCA GGAAAGTATG AACACTTGGA 840
CATTTCTTTT ATTGAAATCT GTGTAAACAG ATGAAGTCAG TCTTTCTCTT TATAACTCTG 900
TAGCACTGAT ATAGATGATG TTATGTTAAA TAGTGTGGTA CACCTGCGTT AACTCAGCTG 960
CTGTAACCTA GAGGGGAGGA GAAAATACTA ATGAACCTAA TTTTAAAGGG TGGTATTGAT 1020
AACAGATTTT GGCCACAATA TTTGTCATTA TTTGTAGTAA CACCTATCCA AACATGGAAA 1080
CAGCACATAC ATAAGCTAGA TACAAACATT AGCCACACTG TAAAAATGAT ATGATCAATT 1140
AGTCCTGACA GCATGTGTTT TTAGGTCATT TTAACTTACT TAACTTTGCT TTCACACCTG 1200
TGAATCGATT CAGTTGTTCC GAAACAGGGA TTACAAATGT TACATTGTTG CTCTTCGCTC 1260
TTGGTGCGGT TCGCTTTCAC ACTGCAAACT TTCTAATCGG ACCAAAAGAG CTAAAACAAG 1320
TCATGTGAGA GTAAACTCTC CTCACATTGG TCATAGTTTT ACGGTTTATT TTGCGGTTTA 1380
CGTCCCACTC AGCTGTTAGG AGAAGTGGTG GTTTGGTGGT GTTTGACAAG GTGCGTGCGA 1440
CTACACTTTT GTTTCGGAAC CTGTCTCGTT TGCCCAGTTA GCGCGGTTCG TTTGGCATAT 1500
GTAAAACCAC CAATCGCTCT CTGATCCGCG CCAAATCAAT CGCTCCGAGA TCGCTTGAAT 1560
GAGGTGGTCT CGGCTCGACT GAAACGAACT CTGGAGCGGA TCGATTGC 1608