EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-39394 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr25:24959730-24960988 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RUNX1MA0002.2chr25:24960759-24960770GTCTGTGGTTT+6.62
RarbMA0857.1chr25:24960268-24960284CAAGTTCAAAAGGACA+6.03
RargMA0859.1chr25:24960269-24960285AAGTTCAAAAGGACAC+6.29
Enhancer Sequence
CAATTTGGGG ATGGCAAACA GGCCTAAACT GCAATGAAGT GTTGCATCAC TTTCCTTGTG 60
CAGTTGTATG GTTCCTGCTG CCCCGCCAGA TTGTGCTCCT CTTCCGGCTC GCATAATTAG 120
GATGTGACAA AGTAAATTGT ATGCCAAATT ATCCAAAAAA ATTATATATA TTTTGTAATG 180
TATAAAAATG TGGTATAGAA TAAACATTTA GTGTTAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA 240
GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA 300
GATAGATAGA TAGATAGATA GAAAGAAAGA AAGAAAGAAA GAAAGAAAGA AAGAAAGAAA 360
GAAAGAAAGA AAGAAAGAAA GTTGAGGAAG TACTTTTGTG AATTTCTATA CTGAACACTT 420
TCATATGAAT CACAGCAATA CTATTCCAGC TATTCTTAGA AAAGTTCAAG CTATTGGGCA 480
GTTAGTGATT AGCGTGTATG CATAAATGCA TCAATGCATG TTCTAAAACT CAGGTAGACA 540
AGTTCAAAAG GACACATCCA CGCTCCAGGG CTGCAACAAC CAAGCTGAAG GTTGCAGAGG 600
CTATTTGGTT TAATCTTACT GAACACGGAA ACGAATCAAT GACAGATGCA TCCACCTGTC 660
CGTCATGCAA AACAGTATAA CCAACAAACA ATATCAACTG GACTCATATC AACTGACTTC 720
TCTTACTTGG AGATTATAAT CCAATGGCAA AAGCAATGCA TATTACAGTC AAAATGCCTT 780
AAAGCACAAA CCTGTCTGTC CTTTCCCGAG GGTCTTTTCT AAGCGGTATG GTCCCACGTA 840
ATTGGCATGA GGGGTAGTGC TATTTTCTTT CCCAGACAAT GACATGTTTC CCGTCTAAAC 900
ACACTTCACG CGGCGTTGCA GTTCTTGGGA TACAGCAATC CTCTTAATTC TGCGCTGCAC 960
CGGAGGACGC GCTTTACTCC AATTTAACGA TGCCTCTATC TTTTTTTTCC AGTCCGTATC 1020
AGCCAGATAG TCTGTGGTTT AAGTGGGAAA AGGGGTTATT TTAATATGTC CTGTTCCTTC 1080
CTTTTTACGG GCTGAACCGG GTGCTTTAAA ATCCGACTGG CATTGCGGAG ACCTGCACAG 1140
CTCGCGTCCG CCTGTGCAGT TTGCTCTCTG TTGAATAGCC GGTCTGCGAA TCCACCAACG 1200
CTACTACGGT GAAGGCACAC TTGTTAATAT TCAAAAGCTA AGCTTTCGCC ATTGGATA 1258