EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-39334 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr25:23396627-23398521 
TF binding sites/motifs
Number: 51             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BARX2MA1471.1chr25:23398128-23398140GTAATGATTTTT-6.37
CDX2MA0465.1chr25:23397908-23397919AAGCAATAAAA+6.32
DMRTC2MA1479.1chr25:23396983-23396995CATGTATCAATT-6.62
IRF1MA0050.2chr25:23397811-23397832TTTTAGTTTTACTTTTATCTT+6.8
LMX1BMA0703.2chr25:23397653-23397664TTAATTAAATC-6.02
ZNF384MA1125.1chr25:23397915-23397927AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397916-23397928AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397917-23397929AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397918-23397930AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397919-23397931AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397920-23397932AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397921-23397933AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397922-23397934AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397923-23397935AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397924-23397936AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397925-23397937AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397926-23397938AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397927-23397939AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397928-23397940AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397929-23397941AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397930-23397942AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397931-23397943AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397932-23397944AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397933-23397945AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397934-23397946AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397935-23397947AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397936-23397948AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397937-23397949AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397938-23397950AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397939-23397951AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397940-23397952AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397941-23397953AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397942-23397954AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397943-23397955AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397944-23397956AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397945-23397957AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397946-23397958AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397947-23397959AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397948-23397960AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397949-23397961AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397950-23397962AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397951-23397963AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397952-23397964AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397953-23397965AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397954-23397966AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397955-23397967AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397956-23397968AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23397913-23397925ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr25:23397791-23397803TTTTTTTTTTAT-6.27
ZNF384MA1125.1chr25:23397914-23397926TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr25:23397912-23397924AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
ACTTTTAAAA TCAATTGGCT AAAGAGATGT TTGCTTGGTT CAGACTCTAT GTGGTATTTT 60
ATTCCAAACA ATATATTTAA AAAGATTGGT GGCCTTTCTT TTTTAATGAA GTGCAATTAC 120
TCCATTGGTA AATTACCTAT TAAATTAGCT CAATTCCATC AACAAGCTCT TTTAGCCTGG 180
AAACTGACTT ACAGCCACAA CTTCTCACCC CACAAAACCA TTCTATGGAA TAATGGTGAC 240
ATTAAGATAA ATAATAAATC TTTTTTCTGG GATAAATGGT TTAACAAAAA CATTATTTTT 300
GTTTCTGATC TTTTTAACAG TAACGGTGAT CTTTTAACTT ATGAGAGTTT TATAAACATG 360
TATCAATTCC CTATTCGCTA TATGGAATTC AAGTCAATTA TAAAGGCTAT ACCTAGTGGA 420
TTATTATGTC TGATGAAAGC TGCTCTTAGT TATGAGACAG ATACCAAACA ATTGTCACAG 480
TTACTCCTAG GAGGAAAATC TATTCTTAGT AAAGAATGCA ATAATAAGTT TATACGTCAA 540
GTGTCCCAGT CACATAACGC AATCACTCCT AGAGGAAAGT TTTTTTGGGG ATCCATAATT 600
GTTAATATTC AATGGAGGAA AACATGGTTA TTACCATATA AATTCTGTAT TCCTAATAAA 660
ATGAAAGAGG TGCACTTTAA AATTTTGCAC AATATTTACC CATGTAATGC ACTTTTATCC 720
AAATATTGTG ATGTTACTGA TATTTGCACA TTTTGTAAGA ATGAGAGTGA AGACATTTGT 780
CACTTATTTT TTTCTTGCGA TGTATCATCA CTGTTTTGGG ATGATTTAAG CTCATACTGT 840
TTCTCCAAGG TTAATATAAG TGGTAATTTG TACCTTAAGG ATGTTATTTG CTATTTTGAA 900
AACCAAAACA AGGCGTTAGA AGCCACTGTG AACTTTCTTA TACTTGCTGG GAAATTTTAT 960
TTTCACAAAC AGAGGTTTCT TAAAAAAAAT CCAATCTTTA TTGACTTCTT ATGTGAAATA 1020
GAACATTTAA TTAAATCTCT TAGATTAATT GAAAATAAGA AATGTACTTC TTTCTTGGGC 1080
AAATATGATG AGATCTTTCA TGCTACTTGA ATATTTATTT CTTTTTTTTA TTATACTGTC 1140
TTTTTTATTT TTATTTATAT TTTATTTTTT TTTTATGTAC TGTGTTTTAG TTTTACTTTT 1200
ATCTTGTGTA TGTAATGTGA TTGTTGTGTA AAAGAACTGT TATCTTTTAC TATATTCTAA 1260
ATTGTATTAT ACAGTTTCTT GAAGCAATAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA 1320
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AGGTGCACGC GCTCTAACCG GAGGTGGGAG ACGCGTCTCT 1380
ACAGCAACCT CACAACCTCT CCAATGCAGT GCCTCCCAAT ATTTGCAAAC AAGTCATATG 1440
GATCATATTT ATTATCACTT GACAGAAACA GAGGAACGCT GCCAAATGTA GCGAAGTAAG 1500
AGTAATGATT TTTCTCTAAT AATTTACTTG AGTAAAAATA CACATATTTA AATGTACAAT 1560
TGAAAAAAAA TTTACTCAAA AAATACACGT TACACAATAA TTTTACGCAA GTAAATGTAA 1620
TGAAGTAAAT GTTACTCATT ACTACCCACG TCTGGGTGTG CCAGTGTAGA AAAGAGATGT 1680
GTTATGGCGC TTTGTTGGAG CGTTGCTATT TTAAAGAACT AAAATAGACT ACAAAAGACC 1740
AGCAGAAAGC ATGTCTAAAG TAAAGCGCAG AGAGCTTTAG GTTGTGCGCC TTGCTGAATA 1800
CACACAGGAT GTACAACAAT ACACAAGTAT CTTGACAAAT GAAAAAGAAT TAAAATATTA 1860
AATATTACAA AAATTATTAT TCTCTACATA AATA 1894