EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-38758 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr25:8941741-8943127 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr25:8941754-8941765ATATTAATTAA+6.62
HOXD11MA0908.1chr25:8942621-8942631GTCGTAAAAA+6.02
Hmx2MA0897.1chr25:8941785-8941802ATCTTTTAATTGCCTGT-7.08
Hmx3MA0898.1chr25:8941785-8941802ATCTTTTAATTGCCTGT-7.12
LMX1BMA0703.2chr25:8941757-8941768TTAATTAAAAC-6.14
POU1F1MA0784.1chr25:8942238-8942252CTCATTAGCATAAT-7.52
POU3F1MA0786.1chr25:8942239-8942251TCATTAGCATAA-6.22
POU3F2MA0787.1chr25:8942239-8942251TCATTAGCATAA-6.44
POU3F3MA0788.1chr25:8942239-8942252TCATTAGCATAAT-6.36
Enhancer Sequence
AGTTTTATAT AACATATTAA TTAAAACTAA ATTGAACTTT AAACATCTTT TAATTGCCTG 60
TGATTGTATA ATATTTCACA GATTGTTCCC ATTCGTTGGT CGTGTCTAGT TAGCGCACAT 120
GCAATCGCAA CAGATTTTCC TTTAAGACCT GCATTCGACA CTGAAATCAC ACTCTTGGTA 180
ATGCATCTGT GACAGTCTGG ATGTAATGTG CTGTTAAAAT AGTCTCCTCG GTGTGCATCT 240
GAGTGGTCTG TGGCATCGGG TTCGGTGTGG AGCAGAATGA TTCACTCTCA TTACACCAAA 300
TATCGAATGC GTGAGTCACA CATCACATTT TGGCAGGAGG GGAAGCTCGG ATTTTGTAAA 360
AATTCTCCTT ATTTCCCGCA GGCTTATATT TGCATTAACT GTTTCTGCTT GGCGGCTCTT 420
TAAAGGAACG AGAGAAATTA GGCGACTGTT GTTGAAAGAA CGAGAGAGAG AGTGAAGAAG 480
GGAACAGCTG TGCCTTCCTC ATTAGCATAA TGTTTTTGTT TTTCGGTGGG GGCTTCGAGC 540
CCTCGTGCAG TTGTGTGTTT GTTTTGGAGG CCGAGAGATG TGTGTGCAAG AGTGCAAAAC 600
AAAAACCCGT AACCACGAGT GCCTGAAGAA CAGTGAAAAA CACAAACAGC GGAGCACCTG 660
TGTCTGAAGA GCAGGGCCAT GAAGAGAAGG CTCAGCGAAT CCCCTGAGGC GCAACGCAAA 720
ATAAAGGATT CCTCCGGTGT CTCTGAGCGC TTTATTCTCC TGCTCAAGCG CACTTACATG 780
CCGGTGTTCA CACTTACACC CGCCGCAGAA CAAACCTGTT GAGTTCTGGA GTGGATTTGC 840
ATACGGCGAT GGCAAATGAA GGCTAGTTTT TTCTAGCTCT GTCGTAAAAA GAGACAGACG 900
ATAAGAAACT GAGAATGAAA TGCAAGGCAC AACACAACAG TTCTACAGTG TTTGCATTAT 960
AATGATGAAC GTATACTATT TTACATTAGG ATTGATTTTG CTCGAGCAGT ATTTATGCGA 1020
CAGAGGCTGA CAAGTAGGGC TGATACTGGG AAGATATGCA GTGTTGTTGA GTATTGTTAT 1080
TAGGACTGTG ACGGTAACAG ATTTTTTGTT ACCGCAGTGA TGAAGTAAGA AATCAAGGGG 1140
TAACATTATG TCGGTTAACC GAATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT 1200
ATATATATAT ATATATATGT ATGTATATGT GTGTATGTAT GTATATATAT ATGTGTATGT 1260
ATATATATAC AATGTTGGGC AGTAGCGTCG CTACAAGTAG TGACGCTACT AGCTTAACTA 1320
CATTTCTCAG TAGCTTGGCA GTAGCTTACT GCCACCTCTG ATTGGTGATG TCGCCAACCG 1380
AAACTT 1386