EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-38532 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr25:3520657-3521809 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA9MA0594.2chr25:3521321-3521331CGTTTACGAC-6.02
RFX1MA0509.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.41
RFX1MA0509.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.41
RFX2MA0600.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.37
RFX2MA0600.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.37
RFX3MA0798.1chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.39
RFX3MA0798.1chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.39
RFX4MA0799.1chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.07
RFX4MA0799.1chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.07
RFX5MA0510.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.49
RFX5MA0510.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.49
Enhancer Sequence
TACAGATATT TTAATGTTTA AATAAATGGG TGAAATCTAG TGGTTTATAG GATATAAACC 60
TTTAAATTAA CGTTATACAA AATATAAAGT TTTAAACTGA TTTTGGGATG GACTGAGATC 120
TCTAAAAGAA GGTGTTTTAA TACTTCATCA ATGACTGACA AGATGATATT TAATATTTGA 180
TATTTAAAGT AACGTTACAG TTACACTGAA TGACATTTTA GTCGATGTCT TTTGTAAAAC 240
ATGTAAAATA GTGATATTAT TTAGCTGCGA AACATAAAAC TAAGCAGAAA ACATTACTAA 300
TGTACGAAAT GAAAACATTT TAATGCTTAT TTTTTTCCTT TGATGCTTGA AATCCAATTT 360
TCGCCTTTGT CTCCTATACA GCGTATTACA TAAGAGGTAA ATGTGACAAA TATAACACGA 420
AAATACAACA TTATTGTGTG TTAAGCAAAG CTCATAATCT CAATGCTCAG ATCAATCACC 480
TCAACACGTT AATCTGCAAT GGTAGTTAAA CAGAATAACA TTACGAGCTT GCAAACTCAC 540
CTACATCGTG GTTTCGCTGC AGGGCGTCTA TCACTGATGT TTTAAAAAAA TAAATAAACA 600
TTAAATATGT TTAAATGATC TCCGTTATCG AGTATGACAC ATAAATGCTG CTCAAACGAT 660
TAGCCGTTTA CGACGCTAGC AAGCTAGCTG CTTCTGTTAC CATGGTAACA GCATGACGCT 720
CATCCTGATC CTAATAATTC ATTTTAAATT GAGTGCCAAA TAAATAATAG TTGAGAAAAC 780
AGAACGGATT ATTTAAATAC ATTTTAACGT GTTGAATGTA TGTTTAATAT CACAAATTCG 840
ACTACTCTAC GAGCACGGAA CTCGCTGTTT TTTCCTCTGC ATTCACACGG AACGTCGGAC 900
ACCAACACGT CACTAAGTAG GCGGAGCTTT AGGGTTTCCA TCGTGCATTG GACGGTTTGA 960
ATCAATGACA GACATGCGTT TCCTCCAATA AGTACACAAC TTGCTTTTTC CTCAAACCTG 1020
ATTGGGTAAA TCTGTCTTGA CGGACAGCAG TACTGTCCAA TCACACTCAA GGATTCACTG 1080
AAGCGACCGT TCGTAGCTTA TTATTCGTCA AAGCAGAATT TAAAACTATT TAAACCGTTT 1140
TGAGCGGGTG CC 1152