EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-38452 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr25:2070881-2071611 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr25:2070950-2070967GTTAGTTAATTAGAGGA+6.01
HNF4GMA0484.1chr25:2070933-2070948AGAGGTCAAAGGTCA+7.22
MIXL1MA0662.1chr25:2070954-2070964GTTAATTAGA-6.02
NR2C2MA0504.1chr25:2070933-2070948AGAGGTCAAAGGTCA+8.25
NR2F1MA0017.2chr25:2070932-2070945CAGAGGTCAAAGG+6.74
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr25:2071172-2071187GAGGTCAAGAGGTCA+8.55
Nr2f6MA0677.1chr25:2070934-2070948GAGGTCAAAGGTCA+8.42
RARAMA0729.1chr25:2071172-2071190GAGGTCAAGAGGTCAGAC+6.12
RXRBMA0855.1chr25:2070934-2070948GAGGTCAAAGGTCA+7.95
RXRGMA0856.1chr25:2070934-2070948GAGGTCAAAGGTCA+8.12
RarbMA0857.1chr25:2071171-2071187GGAGGTCAAGAGGTCA+7.51
RargMA0859.1chr25:2071172-2071188GAGGTCAAGAGGTCAG+7.58
RxraMA0512.2chr25:2070934-2070948GAGGTCAAAGGTCA+8.12
Enhancer Sequence
GGAGAGATGC GCGTCTGCGA GCGCCAGAGC CCGGTTTCGC TTGACTGCCG CCAGAGGTCA 60
AAGGTCAGCG TTAGTTAATT AGAGGAGCTG TCTGGGGTCA CAGAGGTCGA TCCCAAGGGT 120
CCGAGAGGCT TGTCGGCGGC ACTTAATGCG AGCGTAATCT TCACCTTGTC AAAGCAAACA 180
ACTGTCGCAG CCTCTCCATT TAGCCTCCTG ACTAGCGCTC TTGACCCCAG GTCATGACCT 240
TTTTGTCTGA CCCGGCGGGG AGTCAATGGA GCAGATCTTT AGGCACGCGT GGAGGTCAAG 300
AGGTCAGACC ACCTCAAACT GCCTTTTTTT TTCCTCTCCT GTGTGAAGTC GGACCTGAGA 360
TCTGCTTGAG ACGCATGTTT AAATCAGGCC TAAACGCTGT GCATTTGTTT GTTTAAATGC 420
GTGAGCTTTT GAAAACGCTG CTGTTTTAGG AGGAATTACC TTGAGGTTGG TTAGTTTTTC 480
CCGAGGTTAA GGGAGAATCA AAACTCCTGC TGTCGGCTGT TTTCTTGCTG GCTTTCATTT 540
GTCCAGCATT TCCTGTTGTG ACAAACAGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGAATCCGGC 600
GAGGAGAGTC AGGCCTCATA CAGCGTATTT CCCCATGCTA ACGCACTCTC ACGCAGGCCA 660
TCTCGATGTG AAAGAATACA GGAGTCTGCT GCAAAGTATT CAATCTAGTT GGCATTTTAT 720
TTAATTTTTG 730