EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-38230 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr24:40807843-40808754 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESX1MA0644.1chr24:40807918-40807928GTTAATTGGT-6.02
GFI1MA0038.2chr24:40808247-40808259TAAATCACAGCA+6.27
Gfi1bMA0483.1chr24:40808248-40808259AAATCACAGCA+6.62
Hmx2MA0897.1chr24:40807999-40808016ATTGATTAATTGATTTG-6.2
Hmx3MA0898.1chr24:40807999-40808016ATTGATTAATTGATTTG-6.08
PBX1MA0070.1chr24:40807862-40807874TTTGATTGATTG-6.18
PBX1MA0070.1chr24:40807943-40807955TTTGATTGATTG-6.18
RFX2MA0600.2chr24:40808669-40808685TGCTGCCATGGCAACC-6.05
RFX3MA0798.1chr24:40808669-40808685TGCTGCCATGGCAACC-6.26
RFX3MA0798.1chr24:40808669-40808685TGCTGCCATGGCAACC+6.33
RFX5MA0510.2chr24:40808669-40808685TGCTGCCATGGCAACC-6.41
RFX5MA0510.2chr24:40808669-40808685TGCTGCCATGGCAACC+6.55
Enhancer Sequence
TGGTTTATCG ACTGATTAAT TTGATTGATT GATTGATTGA TTGATTGATT GATTGATTTG 60
ATGGTTGGTT GGCTAGTTAA TTGGTTTATC GACTGATTAA TTTGATTGAT TGATTGATTG 120
ATTGATTGAT TGATTGATTG ATTGATTGAT TGATTGATTG ATTAATTGAT TTGATGGTTG 180
GTTTTTTGGT TGGTTGGTTG GTTGGTTGGT TGGTTGGTTG GTTGGTTGGT TGGTTGATTA 240
GTTGATTGGT TTATCGACTG ATTGATTGAT TGATTGATTG ATTGATTGAT TGATTGATTG 300
ATTGATAAAT ACAAACAAAA AATAAAATAA AAGTACATTA ATAAAAATAA TAAGCACATC 360
ATGTGACACT CGAGTCTGTA GTAATGAGGC TGAAAATTCA ACTCTAAATC ACAGCAAAAA 420
CATTACATTT TACTGTATTT CCACATAGAA AACATCTATT TCAGACTAAT AATGTTTAGA 480
ATTTGTTTAT TGTATTTTTG ATTTATGAGA TTTATGTCAG AAACAGCAAG ATAAAGTATT 540
ATAAAAATAA TCAGCACATA AGCATTACAG TTTTCTGATG CACATCTTCC CAGTTTCTCT 600
CATGAACACT TCCAAACAAA TGAATGCATG TAAAGTCAAA CGTGAGAGTG TGTGAATCCT 660
GCATGCTTTA GTTGAGAATG TTGTGTGCGC TGGAGCTGCT GTTAATTGAG TGTGTAATTG 720
CGCTTTGAGC AGCGCAGGTT CGCTGTGTTT GACTCTGAAC AATAAAGCAC AGTGTGATCC 780
GTCAGGTGAC CCAAAACTGG CCTTTGTGCA GGCGCCCGAA ACAATGTGCT GCCATGGCAA 840
CCCTTTTGGC CCTCAGACAC TCGATAGGGC ACCTGCACAC GCTTTCTTTA TTTCTCTTTC 900
TCTCCCCCTC A 911