EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-38210 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr24:40239057-40239918 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr24:40239438-40239453TGGACTCTGACCTCT-6.15
Hnf4aMA0114.3chr24:40239436-40239452GGTGGACTCTGACCTC-6.32
NR2C2MA0504.1chr24:40239489-40239504TGACCTTTGACATCC-6.28
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr24:40239445-40239460TGACCTCTTGACCTC-8.55
Nr2f6MA0677.1chr24:40239489-40239503TGACCTTTGACATC-7.06
RARAMA0729.1chr24:40239442-40239460CTCTGACCTCTTGACCTC-6.31
RXRBMA0855.1chr24:40239489-40239503TGACCTTTGACATC-6.37
RXRGMA0856.1chr24:40239489-40239503TGACCTTTGACATC-6.38
RarbMA0857.1chr24:40239445-40239461TGACCTCTTGACCTCT-8.14
RargMA0859.1chr24:40239444-40239460CTGACCTCTTGACCTC-7.58
RxraMA0512.2chr24:40239489-40239503TGACCTTTGACATC-6.49
Enhancer Sequence
GTGTTCAGAG GTGGGCTGTC CTCCCGGGCG TCTGTACCGT GAGTGTGAGC ATGGCGAGGG 60
CTGTCCGTTC AGCTGTTCTC AGGTCAGTGG TCTGGAGGGC TGTTATTCAG AGGGCTGTGA 120
TGAAGGCTGC CACTGTCCAC CAAACACCTT CCAGCACAAC GGATCCTGCG TCTCTGTGAG 180
CTCACGACAC ACACTCTGTA TATTATAATA CACACTCATT CTGGAGATTT CACGTAGAAC 240
ACTGCTTTCT TTTCAAATGT TTTCCCAATG ATGTGTAACA GAGCAAGGAG TTTTTCAAAT 300
TTGTTTTATT TATTGTGTGT TGTCTGTGTT ATGGTTGTTG TTGTAATGTT GTGTTGTGTC 360
TGCAGGAATG TCCGTGTGTG GTGGACTCTG ACCTCTTGAC CTCTCTACAA AGTGTGTTGG 420
AGACCCCTGA TGTGACCTTT GACATCCACA ACATCACACT AGGCTCAGAG CTGATGTCCG 480
GAGAGGAGCT CATGCTGGAG TGCAGCTCAT GGTGCCACAA GATTACCACT CACTTTCTTT 540
CCTTATGTTC TTTCCTTTTT CTCTTTCTTT TTTTTCTAAT TTTTCTTTCT TTCTTTTATT 600
TCTTTTTCAT GTCCTGCAGC TCCTGTGAGC ATGGTGTGTG GAACTGCACT CTGCTGCCGT 660
GTCCCCGTGA CGGAGGCCTG TCCGCCTGGG GCCCCTGGAG CTCCTGCTCT CTTAGCTGTG 720
GAGGTCTGGG TCAGAGGAGC CGTAGCCGGA GCTGTGAGGA GCCTAGACCT GCTCACGGGG 780
GCCGAGACTG TGAGGGTCCG CTGCTGGACA CGGCCTACTG CCAGACCCCA GACTGCCCAC 840
GTAATGCTGC ATTCACTCAC A 861