EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-37908 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr24:32770334-32772074 
TF binding sites/motifs
Number: 25             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr24:32770619-32770629ATCACGTGAC+6.02
LMX1BMA0703.2chr24:32771593-32771604TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr24:32771582-32771595TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr24:32771586-32771599TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr24:32771579-32771592AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr24:32771583-32771596AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr24:32771587-32771600AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr24:32771578-32771591AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr24:32771590-32771603TAATTAATTAAAT+6
MITFMA0620.2chr24:32770615-32770633CATGATCACGTGACCTAC+6.68
MITFMA0620.2chr24:32770615-32770633CATGATCACGTGACCTAC-6.68
POU6F1MA0628.1chr24:32771580-32771590ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr24:32771584-32771594ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr24:32771588-32771598ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr24:32771580-32771590ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr24:32771584-32771594ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr24:32771588-32771598ATTAATTAAT-6.02
SREBF2(var.2)MA0828.1chr24:32770619-32770629ATCACGTGAC+6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr24:32770619-32770629ATCACGTGAC+6.02
TFEBMA0692.1chr24:32770619-32770629ATCACGTGAC+6.02
USF2MA0526.2chr24:32770617-32770633TGATCACGTGACCTAC-6.76
ZNF24MA1124.1chr24:32771781-32771794CATTCATTCATTT+7.34
ZNF24MA1124.1chr24:32771777-32771790TATTCATTCATTC+7.52
ZNF384MA1125.1chr24:32771428-32771440TTTTTTTTTAGA-6.52
ZNF384MA1125.1chr24:32771402-32771414TATAAAAAAAAA+6.92
Enhancer Sequence
GGAAGTCCAA ACACTGAGGA GCAAATCCAT CGATGCGCAG CTTCACAAGT CTCAAACCAA 60
GCAAGACAGT AACGTCAGTG CCGAGGAACA AACTTTACCA ATTGACGAAA GTGAGGGAAA 120
TAAATCTTTA GAGAAACCAG GCTTGGTTGG GCATCACCAT TTCTCCTCTG GCCAAACTTT 180
TCAACTGACC GTTACTCGAC CATTAGAAAA GTACATTCTA TACAGTATGA GATAATATAT 240
AAGTATAAAT GGAACTCGGA CGTACTACAT CCATCATTTT TCATGATCAC GTGACCTACC 300
CGCGTCAGTT GCATCGCTTG TCACTCCCAT TCATGAAGTC TCGTGGTACA TCATCGGATA 360
GTCTAGCGTG CATTGGATGT TCAGTTCAGA ATAAGCATAG GCCTTTTTTA CGGAAGGTCG 420
TCGCACATAG CTGCCCACCG GTTGAGAATC CCTGCCCTAA AGCATAGTTT TCTCACAGTC 480
GAGTACTACG TTTTAACTTA AATGCAGTAC TTACTGAGTA GTAGGCGATT TCAGATGCAG 540
CCATTGTTAA TTTTGTTATC GCACATTGTT ATTCTAAAAG GTGAACTTTG AATTTCTGCT 600
AAATTAATCT GCTGAAAAAT ATGTTTTGGT AATCTTCAAT CAAAGTCCCC AGGATAAAAA 660
GCTGTTTAAA CGCACACACA CACAAACTCC ATTGAAAATA CTGGAGTAAA ATAAATGTTC 720
ATATTTTAAA GACATGGCAT AGGAAAATGG AATTTAATGC AGTGCTTTTT GTACAATCTT 780
AGACCCACTT CATATCGGAC ATCAATCAGG CATTGAAAAT CATTGTTTTT TAAAGAAAAC 840
AGACCTTAAC CCTCTAGAGC AGGGGTCACC AATCTCGGTC CTGGAGGGCC GGTGTCCCTG 900
CAGGGTTTAG TTCCAACTTG CCTCAACACA CCTGCCTGAG TGTTTCAAGT ATACCAAGTA 960
AGACCTTGAT TAGCTTGTTC AGGTGTGTTT GATTAGGGTG GGAACAAAAA TCTGCAGGAC 1020
ACCGGCAGTT TGGTGACCCC TGGTCTACAG CAAACATTAT GATAAATCTA TAAAAAAAAA 1080
TCTTTGACTT TTTATTTTTT TTTAGAATGG CTTAACTTGT GCTGTAAAAA AAATATATAT 1140
TTTTATGTAC TTTATGATGT GTTGCCATTT GGGAACAACA TCCCACAGTG GATCTAACTT 1200
AGAAAGAATT TTCCCAATAA TAAAAAATTG TGTTGTTTAA AATGAAATTA ATTAATTAAT 1260
TAATTAAATT GGTGTTGCTG TATTACAAGC TTTAACAAAG AACTTATAAA TTACACCTTA 1320
AACATACTTT CCAACAACTC ATATTCCAAC ATCTTTCATT TAATCCATTC TTTTTAGCTG 1380
AATATTATTA AACAACAAAC ATAATATTGT ATTATCAAGT ATACAACAAA CTGTAAATAT 1440
AAATATTCAT TCATTCATTT TCTTGTCCGC TTAGTCCCTT TATTAATCAG GGGTCGTCTA 1500
GCAGAATGAA CCACCAACTT ATCCAGCAAG TTTTTACGCA TCGGATGCCC TTCCAGCCGC 1560
AACCCATCTC TGGGAAACAT CAACACACAC ATTCACAAAC ACACACACAC ACACACATTC 1620
ATACACTACG GACAATTTAG CCTACACAAT TCACCAGTCT TTGGACTGTG GGGGAAATCG 1680
GAGCACCCAG AGGAAACCCA CGCGAATGCA GGGAGAACAT GCAAACTCCA CACAGAAACA 1740