EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-36255 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr23:43844775-43845402 
TF binding sites/motifs
Number: 40             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr23:43845202-43845218AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr23:43845256-43845272AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr23:43845307-43845323AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr23:43845359-43845375AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr23:43845202-43845218AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr23:43845256-43845272AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr23:43845307-43845323AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr23:43845359-43845375AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX2MA0600.2chr23:43845202-43845218AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr23:43845256-43845272AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr23:43845307-43845323AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr23:43845359-43845375AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr23:43845202-43845218AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr23:43845256-43845272AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr23:43845307-43845323AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr23:43845359-43845375AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX3MA0798.1chr23:43845202-43845218AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr23:43845256-43845272AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr23:43845307-43845323AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr23:43845359-43845375AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr23:43845202-43845218AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr23:43845256-43845272AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr23:43845307-43845323AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr23:43845359-43845375AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX4MA0799.1chr23:43845202-43845218AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr23:43845256-43845272AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr23:43845307-43845323AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr23:43845359-43845375AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr23:43845202-43845218AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr23:43845256-43845272AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr23:43845307-43845323AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr23:43845359-43845375AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX5MA0510.2chr23:43845202-43845218AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr23:43845256-43845272AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr23:43845307-43845323AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr23:43845359-43845375AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr23:43845202-43845218AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr23:43845256-43845272AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr23:43845307-43845323AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr23:43845359-43845375AGTTGCTATGGTAACA+7.14
Enhancer Sequence
CAGAGTGATG CAGAGCAGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTCTAGA CTGTGGAAAC 60
GTCACCCAGA GGAAATAATA GCTTGAGCAC AGTCTTGTTC AAAACAGCTG AAGAGTTTCC 120
TGAATGCTCT TAACTCTTCC TCTACTGAAG GACACGTCCT GACCCTGGAT CAGCTCTGAA 180
TGTGACCGCA GACTGCATGC GGATGCCGAC GCTGGCACGT ATTCGACTCC GGGGAGGAAT 240
TTTTTCATTT GGGTGAAAGC CAGACGTCCC CACACTGAGC CTTTATTACT GGGGTCACAC 300
TGCAGAGGTC AGAACAACAC TACAAGACCA GCAGAAACAC TTTACTGTGT TCAACCATAC 360
TATCAATGCT CTGCAGTCAC TACACAACAC AACAACTGTA ATGATTGATC AGTTGTGGTG 420
GTTTTACAGT TGCTATGGTA ACACAACAAC TACAGTAATT GATCCGTTGT GGTGATTCTA 480
CAGTTGCTAT GGTAACACAA CTGCAGTAAT TGATCTGTTG TGGTGATTCT ACAGTTGCTA 540
TGGTAACACA ACTAAAGTTT TTTAATCTGT TGTGGTGATT CTACAGTTGC TATGGTAACA 600
CAACAACTAC AGTAATTGAT CTGTTGT 627