EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-36118 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr23:39294018-39296076 
TF binding sites/motifs
Number: 31             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr23:39295463-39295473GTCACGTGAT-6.02
FOXC2MA0846.1chr23:39294853-39294865TTTGTTTACATA-6.74
FOXK2MA1103.1chr23:39294853-39294864TTTGTTTACAT-6.32
FOXP2MA0593.1chr23:39294853-39294864TTTGTTTACAT-6.14
KLF13MA0657.1chr23:39295888-39295906GACATGGGGGCGTGGCAG-6.01
KLF14MA0740.1chr23:39295891-39295905ATGGGGGCGTGGCA-6.72
KLF16MA0741.1chr23:39295893-39295904GGGGGCGTGGC-6.62
Lhx3MA0135.1chr23:39295093-39295106TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr23:39295108-39295121AAATTAATTATTA+6.25
Lhx3MA0135.1chr23:39295089-39295102TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr23:39295090-39295103AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr23:39295086-39295099GAATAATTAATTA-7.12
PBX2MA1113.1chr23:39295222-39295234CCTGTCAATCAC-7.22
PBX3MA1114.1chr23:39295219-39295236CCACCTGTCAATCACTT-6.14
POU4F1MA0790.1chr23:39295084-39295098ATGAATAATTAATT+7.82
POU4F2MA0683.1chr23:39295084-39295100ATGAATAATTAATTAA+7.91
POU4F3MA0791.1chr23:39295084-39295100ATGAATAATTAATTAA+8
POU6F1MA0628.1chr23:39295091-39295101ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:39295095-39295105ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:39295091-39295101ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:39295095-39295105ATTAATTAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr23:39295566-39295577AAAACAAAGAC+6.14
SOX10MA0442.2chr23:39295154-39295165GTCTTTGTTTT-6.14
SP3MA0746.2chr23:39295892-39295905TGGGGGCGTGGCA-6.41
SP8MA0747.1chr23:39295892-39295904TGGGGGCGTGGC-6.11
SREBF2(var.2)MA0828.1chr23:39295463-39295473GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr23:39295463-39295473GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr23:39295463-39295473GTCACGTGAT-6.02
ZNF384MA1125.1chr23:39294518-39294530TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr23:39294519-39294531TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr23:39294520-39294532TTTTTTTTTTTT-6.22
Enhancer Sequence
TCAAGAATTC TCTGATTGAA AATAGACAGA CTTTAACTCA ATTTCATGTA TGTTTTTTCA 60
CACATACAAA GTTCACCATG TAAATAGCGA ATCCCCCTTG GGCATACCTG CCAACATTTG 120
TCTCTGACAT TCCAGGAGAA CAGGGAGGCG GGGTGGGTGA TGCGTGTGTG TTTGTCTGAA 180
TTACAAAACA CAATAATCTC ATATTCAGCT TTATTTTACA TCTACAGAAT CGTGAGCGAA 240
TCGTGATCTT TATTTTAAGC AAAAAAATTG CGATTCTCAT TTTAGCCAGA ATCGTGCAGC 300
TCTAGTGCAT ATGTATTTAT TATATTTTCA TTTTGTCAAG CCTCCTGTGG ACAGGTGTTG 360
AGAATTATAG TCGGCTAAAA CACCGTAACA CTGTCGATAA TTTCCACATG TTAAAAAAAT 420
AATAATAATT TGACTTCTTG TTATGTGAAC TGTATTAGAA CACTGCCTCC AAAACGTTCA 480
AACTTTGCCT CAATTCAAGG TTTTTTTTTT TTTTGGAGAG GAGTTTTGAC AGTTCAGAGC 540
CACCGTGCAA GCCAAAGGCA AAATACAAAG GCAAAAGCCA CAGACAACTT TGACAAACAG 600
AGTGCATAAT ATAAAACAGA ATGTGGCGGA CAGTTGAGAA CCCCTATATG CTATATTCAG 660
TGACCGGCAC ACCTCTGCCC TGCTGCTGTT TGGGTTGTGT GTGTGTGTGT GTGTCTGTGT 720
GTTTCCAAAC ATTTGACATA CTGCCCATAG ACACAATTGC CTCATTGTTG CTCCGATACG 780
TCAACCCGGC CGCCATCTAT TATATTGTCT GTAGATACTA CCATTCTGTT CGAGATTTGT 840
TTACATACGT GAATGTGTGA AGTATCACAG GTTACTGATT CCACTGATTT CCTCAAATAA 900
ACTTTGCATT TGGGGATAAT TCAGCGCAGC TCTTTAATAA GGAAGAGAAC TCTCCTTTCT 960
CTTTATGCAG TATTGGATGT AAACACTAAG GGTGTCACGA TCCTCCAAAT CCTCGATTCG 1020
ATTACATTTT CGATTCTAAA GTCACGATTC GATTCGATTT TCGATTATGA ATAATTAATT 1080
AATTAATAAC AAATTAATTA TTAGTAGCCT ACCGTTTAAA CTACCTGACC TGCATGGTCT 1140
TTGTTTTACC CATAAACAAA TCATACAGTA AATGAATAAA GGTAAGTTAT ACACATAATT 1200
ACCACCTGTC AATCACTTTT TCTGCGGGAC TCGTGAATCT GTGTCGTTAT AATGGCGTCG 1260
GTAAAAAAGG TCCACAACCA ACAGGAACCA GCCAACAGTA TCTGGAAGTT CGCTAAAATG 1320
ACTAAGTACC TGTGTGAAAG TAAAAGATGG AAGCAGTCTA CTGACCCGCT GACTGCCTTG 1380
ACCCGCTGTC TCGAGCGCAT GACAATGTGT GTGCGTCTGT GTCTGTGTGT GAATGTGTAT 1440
GTGTGGTCAC GTGATGTGCG TTTTCAGCGG TAGTGATGAA GGAGGGCTCC TCAGTAATGC 1500
TACACGCCAG TGTGGATGTG GATCGTTGTC GTTCTAAAAT GCCATTTAAA AACAAAGACA 1560
TATTAGTGTA AACAGGGCCT ATTTTTCGCG AGCGGATTTG CAACGGATGC GGGGCGGAGG 1620
ATCGCGATGC GCCCATCGTC TATCATCCCA ACCGTAATAC GTACATAGCA GAGCTTGCAA 1680
ACTGTGTTTT TTTTGTCGAC AACACGAACG TTGTCAACAT AACTAACTGG AAATCCAAAA 1740
TACTTCCACA CCGGCGACTT CATTGAAAGA GGAGAGGGTT TAAGCTCTGT CGACGGGTCT 1800
CCTGCGTCTG CAGTTTAACG AGCACTTCAA CAAGCCTGTT TTTATCCCGC TTGGCAAGCC 1860
AAGCTGACGT GACATGGGGG CGTGGCAGCA TCGGCGATTC TATTTTTTGA TTCGATAATC 1920
GAAGTTGAGC ATAAATTTCG ATCGATTTCG ATTAAAAATC TAAATCGTGA CACCCCTAGT 1980
AAACACTGTC AAATATTCCT CTTTCTTTTT CTACTTTGGA GAAGAGAGGA GAACAAAGTA 2040
TCTCTGCTTA AATTGACT 2058