EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-35905 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr23:36023401-36024553 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr23:36023716-36023727GTTTTATGGCC-6.62
CDX2MA0465.1chr23:36023717-36023728TTTTATGGCCT-6.02
CDX4MA1473.1chr23:36023716-36023727GTTTTATGGCC-6.32
Enhancer Sequence
TTCTAAAAAA TTAAATACAG TTAGCTAGTC AATTTATACT ACTGATCCAA AAGTGCTTTC 60
ATTTCAGAAT CGTCTCACTC ACCTATATCG AAGGTTCAAT GTAAATTTCC ATGCTTCTTT 120
CAATTTCTAC ACTCGCAATC TTGACCGAAA GGGCCACATT GCGAGTTACT GTGGTTAGTA 180
TGTTGCTTTT TACACAAAGC CCTCTTTTTT AGCCCTCTTG CTACGTATTT TGAAGTTTAG 240
AGGGTTATTT ATGCCAATTG CCCAAAGCAG GACCAGTGAG TGGTGCAGGA AGAGCACGTG 300
GGGTCATTAA AGTGGGTTTT ATGGCCTGCA AGACCTGACA AACCCTCAAT ATATTTACAT 360
CATATATAAT GTTAACTGTC CGTAATCGCA GCTGTTGGCT ACTCTTATCT CTGAGAGAAC 420
GGCTTAGAGC CTGTTAGTGC GGGTTACTCG CGTCAGGGTC TGTAGAAGTT CGACTCTCCC 480
AAATGGATCC CAGGCGGCTG CCGTAAGTTA ATAATCTTGT TTTCCTATTT TTTAATTAAA 540
TGTACTTTCC TCAGCAACAC CCTCGGGAAT TAATCAAAGA TGTAATTTAA TAGTTCTTGG 600
AGAAATTGTG TCAAGTGGTG CGCAAATCTG TTCTCATCTG TTCACGTTTT CTGAGGTCCA 660
GAACGTAGGC TTGTGCATTT GTATATAACT GTTAATTTGG CACTCATGTG GAATTATTGT 720
TCTGGCGATA GATACAAATC GAATTCTCTA TATCATGATT CTTAAGTACT CTAAAACATC 780
TTAAAAGCAT TGTAATGTGT GAACAGATTT GCATCAGATC GTTTTGTTTA TATGCACAGA 840
AATGTTTGCG TTCTCGTATC AATTAATATG CTCAAAAGTG CATAGTTTGT GCCTAGGATG 900
TGTATGTTGT GGAAAAAGGG AAGGTGACGG AGTGTGAGAA GCCAAGTGAT CTTGTATTGG 960
TTTGTAGATG AGAGCGCAGA ACATAGATCT TTAGATCGGA CATAATGTGG GGTCATGTAC 1020
AGGGCAAAGA AGATGTGGTG TTGTGGTGGG GTCATGTACA GGGCAGTGTG GATGATGAGG 1080
TATAGTCACA TGATGAACCA AACAAAAAAG CATAACTTAA ATTATTCTAA ATGGTTTAAA 1140
GGCACATGAG AA 1152