EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-35141 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr23:24554629-24556078 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr23:24554769-24554780TATAAACAATA-6.32
HNF1AMA0046.2chr23:24555203-24555218AATTAATTATTTACT+6.47
HNF1BMA0153.2chr23:24555204-24555217ATTAATTATTTAC-6.42
HNF4A(var.2)MA1494.1chr23:24555929-24555944GAATCCAAAGGTCAG+6.09
Lhx3MA0135.1chr23:24555202-24555215GAATTAATTATTT+6.22
NR2F2MA1111.1chr23:24555934-24555945CAAAGGTCAGA+6.14
PBX2MA1113.1chr23:24554682-24554694GCTGTCAATCAT-6.44
POU4F1MA0790.1chr23:24555203-24555217AATTAATTATTTAC-6.11
Enhancer Sequence
TAAACTACAT ATGCATTTAT TAAACATTAT ATGCATTTAT TAAACATTAA TTTGCTGTCA 60
ATCATCACAA GAATAAACAA AACATATGTA AATGAACGTC AGGCGTTCAT GAGGCTTAAA 120
ACAACACTTG GTTTGCAAAC TATAAACAAT AGGCATTCAA ATTGTGCTCT AGGTGAGCAG 180
CTGTCTGACA CACCAGTTCT CACACTCACA ACACAATCTC CGTCGCCATT TTACAAACCT 240
ATTCACACTG CTTATTCATT CTCCCGTCCC CCATCTTCAA TAAGTACCTC TGCCGCACTG 300
ACCTGAGCTT TGACAGTCAC CGTACACAAA TCACTTCAGG GTACTTAAAT ATGTCGCATT 360
TTATTTTAGA AATCTAGATT TATGCGTTTA TCTCTGGTTT TCTCGGACAA CAATTCCTCC 420
TTTATTATTC CTTCCTAAAA TGAACATAAG CGGGATTTAA TTTAGTTCCC GTTCAAAGGG 480
CGACCGTTAT TACAACGATT CAAAGCTAAC TTAAATGGAC AGGCATTTGA ACAAAAGGCT 540
GCCGTTGAGA CAACAAAGCG GTGGGTTCAA AATGAATTAA TTATTTACTC AATCTTTTTT 600
GCAGGTTCTT ATATTAGCGT ACCTCCTGTG TGCTCAACTC GCAAAGTAAT ACCTTAGGAT 660
ATTGAGGCAT GTTCATTAAA CTTAAGTCCG AACATCTGCA TTAATCAGGT ACATATCTTT 720
CAAAAATACC ATTACAATAA GTTTGGTCAC ACCTGCATTT TTAAACGCTA ACCTTACCTT 780
GGGGTGTTTG AGCGTACGTG TAGGTAATGA ATGTGGTCAA TAATGGAAGT CAAGACAATC 840
AAGGGAATTT CGTACACAAT AAACGTTGTT TCAAAGCAGA TTTATGAAAA TGTATATCTT 900
AATGCTTCAG AAAGCACGAA TGATAATATA GTTTGAGTCA TAATATAGTT TACATTTTGC 960
GACGATGTAA ACAATCGGAC AATTTAGATT TGCTCAATAT TATCGCTTTC AGTGGCTAAT 1020
TAATGTGGGT AAAGTTTGGA TATGTTAAAA ATATATAGCC TATATATGCT GTGTGATAAT 1080
GTACCTTTAG GATAATATAA ACAATCACGT ACGTTAGCCA TTTAAATTAA GTAATACACA 1140
ATACTGCGAT GTCACTACTG GGATCCATCT CGCCACTGTT TCCGACTTGA ACTTAGATAA 1200
CAGATTTACA CAATTTAGTT TCAAGAAACC GTGTCATTAT GACTCGGTTA TGCATTCCAA 1260
CCATAAATCA GGTGACTTTT GAGTGAATTC AACGACACCT GAATCCAAAG GTCAGAAAAA 1320
TAATAAAACT CTCCAGCATG CGAGTACAAC GTGCAGACAT TGTTGGCTTT CTATCCGTTT 1380
TAACACTAAG AAAATATAAA ATCATTCTTA ATGCCACGAT TTGTGAGTAT AAATTATTAA 1440
TCTCACCGC 1449