EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-34716 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr23:19885805-19887011 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr23:19886972-19886985AAAAGCACTTAAA+6.03
PBX1MA0070.1chr23:19886364-19886376CCATCAATCAAA+7.22
ZNF384MA1125.1chr23:19886250-19886262TTTTTTTTTTGA-6.11
ZNF384MA1125.1chr23:19886248-19886260TTTTTTTTTTTT-6.22
Enhancer Sequence
TGATGCATCA AAACACAACC TAAAGAAAAG TTTCTGAGTA AATGCATCAG GTTGACGCCC 60
ATCACTGGCA TGCAGATGAG TCAGAAGAAC AGTCAAGAGA CATAAGCAGC TGTTCAGTCC 120
ATATTAGGAA AGCGGAACTC TGGTTTTCAG GGCCCTTATC TGTTTATTGA TTAAGGCCCC 180
CAGGTGAGGT CCTTATTAAA TGGGCCCCGG GTATTTTATT TTTATTGACC TTTTTTCCGC 240
TTTGAGATAT TCCATTTAAA TAGTTTTGTC AAAGTTTTGA CAATCTGTCA CACACAGTTT 300
ACAAAGGTAC TTGTTCGGGC GGTTTAGTTT GTATAAAGTA GATAGCAGTC AGATAAACGA 360
TGGCTCCTGC TGAATCATGT TATCTTGCTC TGTCGTTGCC AACGCGAAAA CAAATACACA 420
ACATTCGGGG TTTTTCCCTG AGATTTTTTT TTTTTGAGAA GTCGCGATGT CGCCCCTTTG 480
CGGTACATAT GTGTACTGCA TCTGGTTGCT TAAAGGTACC GTTCACCCAC AATTAAGGCA 540
TTGTTTTCAT ATGCATCAGC CATCAATCAA AACTGTCAAG AGCGTCTCAA ATTCTGTGAA 600
ACGTGTATTA CATGTCCACT AAGTTGGTAT TATTTATTTT AAAATGCTTG GAAAGTTGAA 660
GCGCAAATGA TTGAAAATAA GGGTGGTGCA TATACATTGT ATTTAAAGAC AGAACAGACT 720
GACATTCAGG ACGTTACATT GAAACAACTG ACTCTAGGCT ATTTAAGTGA TTTATAAAGC 780
TTTGTTGTTT AATTGGAAAA ATTAATAAGC TGTAATTTTG CATACTCAAA AAAAAACACA 840
AAACAAAAAA TAATATACAG TTGCCTTATT TGTTATTTTA TCAAGCATTT TCTAATGCCT 900
AAGACGTTTC CTATATTAAA AAAGTAACAC ACACACACAC ACACGCACAC ACACACACAT 960
ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAC 1020
ATACATACAT ATTTATAATA ATAAAAAGAG AGATTATAGG TTATAAATTA TAATGCATTT 1080
TATTTCAAAT TGTGTTGAAT CAGTGAACTG AATAGACTGA AAATTCTTTT TAGTTAACTT 1140
GCTGATTCTG ATTAGTTGAA ATTGCTTAAA AGCACTTAAA ATTTAGTTAT TATTTCTTGT 1200
ATAAAT 1206