EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-34130 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr23:6245273-6246397 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr23:6246345-6246356CATTGTTTATT+6.02
Hmx3MA0898.1chr23:6246318-6246335TTTCTTTAATTACTTGT-6.03
Sox11MA0869.1chr23:6246197-6246212GACAATTTCAGTGCT+6
Enhancer Sequence
TCTGAAGTGG CCCACCTGTA CAATGCCAAA GTGGGTCCAA AGATTAAAAT TCATAAATGG 60
CAAAAGGCAA AGATTTGGCA CTTATGGCAA AATGTAATCT GAATGTGAGC CCATGTGGAA 120
ATTGATCAAT TTGGCCCAAA TGATGGAGGA CAAATGTGGG CCACAGTTGG CAAAAAATGT 180
GGCATACATT TTAGGGTAAT CTGAGTCTAA ACCTAAAGTG GCTCACACGT GTAGGTGCAA 240
ATGTGGCCCA GTTATCCTAA GACACATGTG GGCCAGTAAA CTGAACTAAT CTGGACTGTA 300
CTAGAACTTC TATGTTAGCT GCTTTAACAA ATAAGCTGCT TTGACACATT GTAAAAGCGC 360
TACTGAAATA AACATGAATT GAATTCAATC GCAGCATAAA TAAAGCAATT CTAAAAGTAA 420
AATGAGATGC AACCTAATCC CTGCTTCATA ATTAGTTGTA CTTGATAAAG TGCTAATGAT 480
ATTGGTTCCT GTGTTATTGC CTGTACTTTT TCTATTTTGT ACAACAGCAT TACATAAAAT 540
AATGTTAAAG GCATTATTTT TAGTTTCTAA ATATTCTACC TCTGTTCATT CATCCCCTTC 600
ATGTGATATT GCAGAGCTCA GCTATCATCG GTGTGTGAAA GAGAGAGAGA AAGACAAAAT 660
GAGCAAGAGC CAACAGGAAT AAGGATAGAC AGGCCTCATA AATTGTCTCC ATCCAATTAA 720
AGGCTAGAGC ATAGATTACT GTGCAGCGGC TCAGCCAATC AGGAGACACT GCTGGCAAGT 780
ACAGCAGTAA AATATTGAAG GGCTGAGTGA GCATGTATGT TCTCCTCTGC TTCTACACCC 840
ACTGATCCTT AAGCTGTGGG CCGGTTAGTG AATGACACCA GGCTTCCCAA GCCAACATTT 900
ATTTTTTAAA GAAAACCCAA AGGAGACAAT TTCAGTGCTT TTCTAAGTCC CTTTGGCTTG 960
ACATTCCATT AAGTTCCTCG CTAGGACATT CAGCACGTAT GGTAAGTGGC TTTTAAAATA 1020
TGATGCATGC ATTTTATATC CAGGGTTTCT TTAATTACTT GTCAATCCTT GTCATTGTTT 1080
ATTCTGTCAT TTTACTAAAT GCTTAATAAC CCATTTTGTT TAAG 1124