EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-34022 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr23:3821811-3822898 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
SIX2MA1119.1chr23:3822124-3822140TTTTGAAACCTGATTC+6.44
ZIC1MA0696.1chr23:3821860-3821874CGCAGCAGGGGGTC-7.64
ZIC3MA0697.1chr23:3821859-3821874GCGCAGCAGGGGGTC-8.18
ZIC4MA0751.1chr23:3821859-3821874GCGCAGCAGGGGGTC-7.6
Enhancer Sequence
AATAAAAGCC ATTTTCTCAG TCTTCCCGCT GTCCTGTCTG GAGGGGACGC GCAGCAGGGG 60
GTCAGGATCT CCCGTCCTCA GTCAGATTAT GCAGTAACAC ACACACACAC ACACGCACGC 120
ACACGCACGC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 180
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACGAACTGTG GGCTGGACGC ACTGAAGGAG 240
GAGGAACAGG CGCGTTTATT TTCTGAATGA AGGCAGAGGA GGAACTTGGA GCGCAGAAAC 300
AAAGCCCCGC CATTTTTGAA ACCTGATTCA CTATCTGTGA GTCAACTGTG AGTCAGGCAA 360
ACACAGGAAA CCTGCACATT CTGGCAGGAC AAACGAGCGC ACGTTTACGC CAAATTCATA 420
GTAAACAGAT GTAAATCACA GGGCAAAGAT GTAAATAAAC GCCAGCTTCC TCGTTTTTCA 480
GCGATTCGTC ATATGATATA GGCTACATAT CATACATGTG GACAATTGAT TCAATACCCG 540
AAGAGTGTGT GTCTGCTCAC TGTGATTCAG CGTGTGTGTG AATTGAATTA TATATCAGAC 600
TCATATGTTC AAAGAGGTTT GAATGTCCAG TAATTTTTCA TTTTTACCAA GCCAGTGGCA 660
GAAATAGCTA TTTATTTATT TATTTAATTG TTCAAGCTAA CCCTGCTGAA AAATCCAGCT 720
TAAACCAGCC TAGGCTGGTT GGCTGGTTTT AGCTGGTGGA CCAGGCTGGT TTTAGAGGGG 780
TTTTGGCCAT TTCCAGGCTG GCTTCCAGCC ATTTCCAGCC TGGTCTTAGT TGGTCAGGCT 840
GGAAAATGAC CAGCTAAATC CAGCTTAAAC CAGCTTGACC AGCCTGGTTT AAGCTGGACT 900
TAGCTGGTTT TGGCTAGGCT CCCGGCCTGG CTAGGCTGGT CAAGCTGGTT TCAGCTGGGC 960
CAAAACCCCT CTAAAACCAG CCTGGTCGAC CAGCTAAAAC CGGCCAACCA GCCTAGGCTG 1020
GTTTAAGCTG TTTTTTTTCA GTAGGGAAAT TTTTAACAGT TGTATTATTT TAAACGATAA 1080
ACATCGA 1087