EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-33987 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr23:2956878-2957686 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr23:2957365-2957382AGTAATTAATTAATACA-6.47
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT-6.02
Lhx3MA0135.1chr23:2957367-2957380TAATTAATTAATA+6.25
MSCMA0665.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:2957369-2957379ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:2957369-2957379ATTAATTAAT-6.02
Tcf21MA0832.1chr23:2957432-2957446GAAACAGCTGTTTA+6.03
ZNF384MA1125.1chr23:2957448-2957460AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr23:2957449-2957461AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr23:2957446-2957458ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr23:2957447-2957459TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr23:2957445-2957457AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
TATTATAAAC CATAACCACA AACTACATCC CCGCCCCTTC TTCCTGTCGC CATTACAACA 60
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 120
CACACACACA CACACACACT TTCCACGCAT CAGTGCAGTA TAAGCTGCTG TAATGATAGA 180
TAGTGACGTC GTTGAGTAAC AATGAAAGTC GAGCACAAAC TCACCCGCGT GCACGAGCCA 240
GATGCCGTCA GAAACGCGCC ATACACACAT CAACGCTGGA AGATAGAAAC ATGAGTGTAA 300
CACAAAGGCC CTTCACTCTT GTTTATGTCC AGTCGAGTGT GTGTCTGTGT GTGAGAGAGT 360
GTGTGTGTGT GTGTGTTAAA CGGGGAAAGA AACTCACGCC GTACGTCACC AGCAGCTGCG 420
TCATGTGACT GTATGCGTCA CTGGCATCCG AAGCTGTGAT GATCCGCTCA TGGGGAAACT 480
GATAATGAGT AATTAATTAA TACACAAACA CGCACTGTTA TGACTGAATC TCATCTCTGT 540
GTCCAGAGCA AACGGAAACA GCTGTTTAAT AAAAAAAAAA AAAGTTCATG ATAGTTGAAG 600
TTGTAGTGAT GCCACCGGGT AAGCAGGTTT GTGTAATTTG TTTGTGATTT GCTGCAAGGT 660
CAAATGAGGT ATCCCTGCTG AAAAATCCAG CTTAAACCAG TCTTGGATGG TTGGCGGGTT 720
TTAACTGGTC GACCAGTATG GTTTTAGAGG GGTTTTGGAC ACTTCCAGGC TGGTTTCCAG 780
CCTGATTTTA GCTGGTCTGG CTGGAAAG 808