EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-33857 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr23:1125103-1126298 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr23:1125201-1125212GTTTTATTGGG-6.62
HOXB13MA0901.2chr23:1125201-1125212GTTTTATTGGG-6.62
HOXD13MA0909.2chr23:1125201-1125212GTTTTATTGGG-6.62
IRF1MA0050.2chr23:1126215-1126236GGAAAAAAAGTGAAAGTGTTT-6.23
NEUROG1MA0623.2chr23:1125514-1125524GACATATGTC+6.02
NEUROG1MA0623.2chr23:1125514-1125524GACATATGTC-6.02
POU4F2MA0683.1chr23:1126053-1126069TTGAATATTTAATCAA+6.16
RESTMA0138.2chr23:1125263-1125284AGCTCTGTCCTAGGTGCTGTT-6.9
Enhancer Sequence
GTGTGTGTGT GTGTGTCGTA CATTCTTTTA ACAAACGCTA CCTTTAGTTC ACCAATAGGA 60
GGCAGTATAA TACACTGATT TAACATTATA TTTTATTGGT TTTATTGGGG ATTTTTCCTC 120
TCCTTCGGGC ATTAGTGTTA CCTGCTGTGT CCATTCCTAC AGCTCTGTCC TAGGTGCTGT 180
TCATTAGTGC TCACCTTACC TCCTGTCCTC CATCCATCCA TCTATTCATC CAGGGTTTGT 240
CAACATACAT GATTCAATGC CATACAACAT TCCGCAAAAA CCTCAAGAAT CTTAATTTTC 300
CGGCATGTTT TACTCCTCAT GTGTACTGCA AGCCGTAAGT TTATCTTCAT TCTTGTTACA 360
GTAAAGCAGA TTAAAAAGTG TTTTACCAGG AGTGGGGTTC GAACCCACGC GGACATATGT 420
CCATTGGATC TTAAGTCCAA CGCCTTAACC ACTCGGCCAT CCTGGTGAAC ATACATTTCT 480
TTAAAGCCAG AAGACCTTAT ATGTGAACAG CAATCAGCCA TGGGAATATC AAACTATGTA 540
TGTCTAGATG TGAAATTTAT GTAATCTATG CATGCTGTTC ATGCAGACTT TACTGTCATA 600
TTTACAACCG AGTTGCAGCT TGCTAACTGA CTGTTAGCAT GCTAGTGGAC TCGCTTACAA 660
AAACAACCAA AACGTTTATA TACGTTTGAT TTTTAACTAG CGTACACGAT TGAAGACTAT 720
TTATAAATCT AGCCATTTTT ATAATGCGAT ATTTTAAGTC GTTTTTACAA CAATGAGGTT 780
ATATTGTTTG ACGTTTGTCT CACAGTTAGA AAGAGCGCTA AGAAGTAAGT TAAAGCTAAT 840
GCAAACATCC AGGCTCCTTA CGCAAGCGTA TGTTGTAACA ATATTTCGAA AGTAAAAAGA 900
GAACAAGATT CCTGTGTTAC ATTATGTTTT GAAACTGCAA ATACGGTATT TTGAATATTT 960
AATCAAATCA GAAAAAGCTG TGACTTAGAC TGTTGGTAAA TCCATGGTAA ACCCTCATAA 1020
CTCAGCCCTG CCTCCACGTA AGTGCCACAC ACAGACGGTT TGGATTGTTT CTGCTTTTCT 1080
GAAGTGAAAG AGGAAATAAA ATCAGGTTGT TTGGAAAAAA AGTGAAAGTG TTTCAGTAGC 1140
TACTCGTGTC TGTAATTGCT AATACTTGAT CTATTTGAGG AGAGAAGATG AATTT 1195