EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-30675 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr21:13875968-13876446 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr21:13875973-13875990GGGATTAATTAATTATT+6.14
Lhx3MA0135.1chr21:13875978-13875991TAATTAATTATTC+7.12
Lhx3MA0135.1chr21:13875975-13875988GATTAATTAATTA-7.34
POU4F1MA0790.1chr21:13875979-13875993AATTAATTATTCAC-6.98
POU4F2MA0683.1chr21:13875977-13875993TTAATTAATTATTCAC-7.59
POU4F3MA0791.1chr21:13875977-13875993TTAATTAATTATTCAC-7.42
POU6F1MA0628.1chr21:13875976-13875986ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr21:13875976-13875986ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
GTATTGGGAT TAATTAATTA TTCACAAGAG AAGAGTGAAC GACGTCGGTT TGAGGGCGGG 60
GCTTCGCTGT CAAATTCAAC AAAATGCTGA ACTGGGCGCT TTGGTTGGCT CAGCAGGGAA 120
AGGGGAAGGG CTAAACTTTC AGATAATTTA TAAAGCTCAT ACAACAGCAT TTTTTTCTTT 180
AACTTTAATT TACAAAGAAT AACATGCTTT GTCATGCTCA GTATTCAAAT GTAGCTCTAT 240
TTTGGGCATC ATTCTTTTAT TATAGTCTTA AATGAACGTG ATATCACTAT CAGCCACACG 300
ATGGAGCCAT ATGTCGTCTT TTTAATATCT GTACAGATCA GTAATCCACA CATTTTAACA 360
GTATAGTGTT CTTATTCATC AACTTATACT TACAATCTCA TCCAGTTATT GTACATTCGA 420
TGCTTTTGAA CACAATTACA ATAATTAAGC CTGCAATTAA TTATTTTTTC ATATGTGT 478