EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-30291 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr21:4028716-4029520 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATOH1(var.2)MA1467.1chr21:4029207-4029217GACAGCTGTT-6.02
HNF4GMA0484.1chr21:4029298-4029313TGACCTTTGACCTCA-6.55
NR2C2MA0504.1chr21:4029298-4029313TGACCTTTGACCTCA-7.73
NR2F1MA0017.2chr21:4029294-4029307CTCTTGACCTTTG-7.52
Nr2f6MA0677.1chr21:4029298-4029312TGACCTTTGACCTC-8.42
POU4F2MA0683.1chr21:4028904-4028920GTGAATATTAAATTAA+6.19
RFX1MA0509.2chr21:4029247-4029263GGTTGCCATGGTAATG+6.02
RFX1MA0509.2chr21:4029247-4029263GGTTGCCATGGTAATG-6.05
RFX2MA0600.2chr21:4029247-4029263GGTTGCCATGGTAATG-6.54
RFX2MA0600.2chr21:4029247-4029263GGTTGCCATGGTAATG+6.63
RFX3MA0798.1chr21:4029247-4029263GGTTGCCATGGTAATG+6.67
RFX3MA0798.1chr21:4029247-4029263GGTTGCCATGGTAATG-6.89
RFX4MA0799.1chr21:4029247-4029263GGTTGCCATGGTAATG+6.06
RFX4MA0799.1chr21:4029247-4029263GGTTGCCATGGTAATG-6.75
RFX5MA0510.2chr21:4029247-4029263GGTTGCCATGGTAATG+6.84
RFX5MA0510.2chr21:4029247-4029263GGTTGCCATGGTAATG-6.97
RXRBMA0855.1chr21:4029298-4029312TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRGMA0856.1chr21:4029298-4029312TGACCTTTGACCTC-8.12
RxraMA0512.2chr21:4029298-4029312TGACCTTTGACCTC-8.12
Enhancer Sequence
CAATGGCGTT AGTTGCAGCA GATTGATTCT GCAGGACAAT AATAAACTTT GACACCTTTA 60
TGGTTCTTGC ACATATTAAA ATTTAAGGAC ACGACTGAAC AAGGAGGACG ATCTCCAAGT 120
GGCTCCAAAA TTAAACCAAG AATAGTCTTG TGCTGTAAAC ATTGTGCTCA TCATTCTCAT 180
TAAGTGAGGT GAATATTAAA TTAAACAAAC GAATAATGAT TATATAAAAT GTATATGGTT 240
GTAAGACTGT TGCACATTTT TTGTGTTGCG CCATTGTGTG CAATATTTGT GTGCTTATGA 300
TAATAGTCGC CAGTCACTGG AGTTGTTATT TTAGGGGTCG CGGCTGAAAT GTTTGAGAAC 360
CCCTGATCTA GGGGCACTGA ATGATTACAG CTGAGATGAA CAATAGACAG GAAAATGCAA 420
TCATATGAAG AAATAGAAAA GTGTATTTAA ACAGCGCTAA AATCACTCTG GCTATTGCTG 480
ACCTGAGATC AGACAGCTGT TATTCTCTCC AGTGATGAGT TTTAGAGACT AGGTTGCCAT 540
GGTAATGGAA TCTGGGAATT GTTCTGGAAT GTTTCGCGCT CTTGACCTTT GACCTCAGAG 600
GTCACAGCAG CAGCAGCACA ATGTTTATAT ATGATAATGT GTGTAAGAGA GAGAGTGTGT 660
GTGTATTTGG AAATACTATA TATATGTGTG TATGTATGTA TGTATGTATG TATACTGTGT 720
GTGTGTGTGT GTCAGTAGGA TACACTTGTT TTTATGTGTG TTTGCTTCAG GAAAGGCAAT 780
GTATGTGTGT GTTTAATTTA TGTA 804