EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-30254 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr21:3352265-3353264 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF16MA0741.1chr21:3352862-3352873GCCCCGCCCCC+6.02
KLF5MA0599.1chr21:3352862-3352872GCCCCGCCCC+6.02
NFYAMA0060.3chr21:3353243-3353254TCTGATTGGTT-6.62
NFYBMA0502.1chr21:3353244-3353259CTGATTGGTTGAGTC-6.86
POU1F1MA0784.1chr21:3353160-3353174CTGATTTGCATATG-6.07
POU2F2MA0507.1chr21:3353160-3353173CTGATTTGCATAT+6.5
Pou2f3MA0627.1chr21:3353159-3353175GCTGATTTGCATATGA-6.24
SP2MA0516.2chr21:3352858-3352875AACAGCCCCGCCCCCTT+6.72
SP4MA0685.1chr21:3352859-3352876ACAGCCCCGCCCCCTTT+6.41
ZNF384MA1125.1chr21:3352336-3352348TTTTTTTTTTAA-6.44
Enhancer Sequence
TTGTTTGTTT GTAATATTAC AAGTGATCCA GGATTCTGGC TATATTCATG ATCAAATTAT 60
GCAACAGATA CTTTTTTTTT TAAGTGATGT CATGATTTTG GTGGAATTTG GTAGAATATG 120
GTGGCAAAAG CAGGAGGAGA TTCAGATGTT CAGACAGAGA GTGAGAGAGA GAGAGAGAGA 180
GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGACAAAAA GAGAGAGACA GAGAGAGAGA GAGACAGATG 240
GACAGAGGAG GAAAAGATGT GAAAGGAGGA AGAAGGAGAC ACAAAGCAGG GGTGTGGGGC 300
TTTAATCAGG ACAGCAGACA GAAGTCTGAC CCAGCAGACA CACACACACA CACACACACA 360
CACACACAGA CAGACAGACA CACACACACC GCAGACACAC ACATCAGACA TCTGCAAGAC 420
TCTGGCCTCA GGCTGTTTGT GGAGCAAACA CACACACAAA GTCAGACAGA CACACACACA 480
CACACACTCC ATTTACATGT CTATTGTCCC AGACACTCAG CCCCTCTCTA GGGCACCGAG 540
CAGGTCATTT AGCGGCCTCT AGGGTGTAAC ACTCTGACCT GTGTGACCTC TTAAACAGCC 600
CCGCCCCCTT TACACACAGG CCCCGCCCTC CCTTTATGTC TGCGCCAGGT CTTCATGTCT 660
AGACAGAAGA CCTGTGTGCT GTCTGGACCC GCGCACACAC GTATGCACAC GCAAGCAGGC 720
ACGCACATCT TTATGGAGAC TAATGGAGCT CATGAAGATC ATGTCAAGGT TACTCTTTAC 780
AACAGGTATC ATCATCAGAT GATCAAAACA CCAGCAAGCG TGCATCAGCA GGACACTTAA 840
TATTTCACCA ATGTGCACGA AGACTCTTAG TGTGAAATGT CATCTTTTTA AGCTGCTGAT 900
TTGCATATGA GGGAAAATAA TATGCACTCT TTCAACCATT TGCAGCCAAA TAATGTTTTT 960
GTAGTTTCAG TCCTTGATTC TGATTGGTTG AGTCACGTT 999