EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-30146 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr21:2030190-2032757 
TF binding sites/motifs
Number: 25             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr21:2031764-2031774GTCACGTGAT-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:2031787-2031805GGTAGAGAGGAAGGAGGG+6.09
KLF13MA0657.1chr21:2032198-2032216GACATGGGGGCGTGGCAG-6.01
KLF14MA0740.1chr21:2032201-2032215ATGGGGGCGTGGCA-6.72
KLF16MA0741.1chr21:2032203-2032214GGGGGCGTGGC-6.62
Lhx3MA0135.1chr21:2031413-2031426TAATTAATTAATG+6.46
Lhx3MA0135.1chr21:2031410-2031423GAATAATTAATTA-7.12
Lhx3MA0135.1chr21:2030837-2030850GATTAATTAATTT-7.82
MEF2CMA0497.1chr21:2032225-2032240TTCTATTTTTGGATT-7.64
PBX2MA1113.1chr21:2031542-2031554CCTGTCAATCAC-7.22
PBX3MA1114.1chr21:2031539-2031556CCACCTGTCAATCACTT-6.14
POU4F1MA0790.1chr21:2031408-2031422TTGAATAATTAATT+6.8
POU4F2MA0683.1chr21:2031408-2031424TTGAATAATTAATTAA+7.4
POU4F3MA0791.1chr21:2031408-2031424TTGAATAATTAATTAA+7.29
POU6F1MA0628.1chr21:2030838-2030848ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr21:2031415-2031425ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr21:2030838-2030848ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr21:2031415-2031425ATTAATTAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr21:2031868-2031879AAAACAAAGAC+6.14
SOX10MA0442.2chr21:2031474-2031485GTCTTTGTTTT-6.14
SP3MA0746.2chr21:2032202-2032215TGGGGGCGTGGCA-6.41
SP8MA0747.1chr21:2032202-2032214TGGGGGCGTGGC-6.11
SREBF2(var.2)MA0828.1chr21:2031764-2031774GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr21:2031764-2031774GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr21:2031764-2031774GTCACGTGAT-6.02
Enhancer Sequence
CTCATATACC ATTCTACATC CCTTATATTT ATTTAAAAGA CTTATGTATG CCCAAACTAT 60
CTGTTATTAC TATAATATAC CTTATTGCAA GTTACCTAAA ATAACTCATT TACAATGCTG 120
TACATTTGCT CCTCTCATAA TGAATAATGA TATCATTTAT ATACTAACAC TTTATGTTTC 180
TTTGCCATTA AGTAAATTAT TTTGATATCA ACATTTCACT TGCTTGGTCT GATTTCAAAG 240
GTTGTCACAA TTCATTACTA TTACAATGCA TGCATAATTA CAATGCTTTT TCAGTTCGCT 300
ACTGTAATTA TACTGTACTA AATTAAATGG CCATCTTCTT TGATGCAGCA TTTTTAGATG 360
ACATAAAGCT TAATTTTGTG CATTTGAAAC TTCTAAACCT GCCAAAATAT CCTACTGACT 420
ACTGCAAGCT ATAATTAAAA TCAGTGCACT CCTAATATCA GCATACAATA ACTTTTAGAT 480
TACTTTAAAA TGAGTACTGG AGTCTTATTT ACTATATCAG TACTTATACT TGATTTTTTG 540
ATTAATGTAC AATAGCCACA ACTGTCAGTG TTGCCAGATA TAACTGACTT ATTCCAGCCC 600
AAAACCTATC CAAAGTCACA AAAATTTATA CATCACCCAA AATGTCAGAT TAATTAATTT 660
TATTTTATTT TAATTGAAAT TAACCTAGTT TAATAGTCGG ATTTTTAACC ATGCTGCAAC 720
CAACACCAGC AGTAACAGAA CCACAACATA ACCGGTTCAC ATCGAAACAC TGCGCCCCCT 780
TACCCTCACA CTGCACTTAA TGTTGTGTAG ATTGCACTAG CTAAAAGGGT GTGTTTTACT 840
TCTGAAATGG GGTATAAAGT CATCCCATTT GGCCTTTTGA ATTCTTTTGA ACATAATAAG 900
GTGCTGCTTG TCAATCAGAC AACGCTTCTA TGTTTGTTCA TGCTGTCAAT TGTGAAAAAA 960
GAAATTACTG ATTAAAGTGT CATGATAAAC CGCAGTGAGT TTCACTGCAG GCTCCTGTGA 1020
TGCACGTGCA CTCAAAGGGG AGTCAGATTT GATGCAACTT TCCTTCCCCT CCTCTTGCGG 1080
GTGAGCCCAT GCGGTTTGCA CTATGCACTG GTCACTACTA ACTGAATTGA GTAGGAGCTA 1140
AGGGTGTCAC GATCCTCCAA ATCCTCGATT CGATTACATT TTCGATTCTG AAGGCACGAT 1200
TCGATTCGAT TTTCGATTTT GAATAATTAA TTAATGACCA ATTAATTATT TGTAGCCTAC 1260
CGTTTAAACT ACCTGACCTG CATGGTCTTT GTTTTACCCA TAAACAAATC ACACAGTAAA 1320
TGAATAAAGG CAAGATACAC ACATAATTAC CACCTGTCAA TCACTTTTTC TGCGGGACTC 1380
GTGAATAGGC AGTGATCTGT GTCGTTATAA TGGCGTCGGT AAAAAAGACG CACAACCAAC 1440
AGGAACCAGC CAACAGTATC TGAGGTGTTC GCTAAAATGA CTAAGTACAA GTGAGTGAAA 1500
GATTGAAGCA GTCCTCTGAC TGCCTGGACC TGCTGTCTCG AGCGCATGGC TGTGTGTGCG 1560
TCTGTGTCTG TGTGGTCACG TGATGTGCAT TTTCAGAGGT AGAGAGGAAG GAGGGCTGCT 1620
CAGAAATGCT ACACGCCACT GTGGATGTCA AATCGTTGTC GTTCTAAAAT GCCATTTAAA 1680
AACAAAGACA GTGTAAACAG GGCCTGAGTG TGAACTTTTC GCGAGCGGAT TTGCAACGGG 1740
GGCGGGCGGA GGATCGCGAT GCCGGTGTTG TCTATCGGAC GAACCGTACG TAATACATAC 1800
ATAGCAGAGC TTGCAAAACT GTGTTTTTTT TTTGTCGACA ACACGAACGT TGTCAACATA 1860
ACTCACTGGA AATCCAAAAT GCTTCCACAC CGGCGACTTC ATTGAAAGAG GAGAGGGTTT 1920
AAGCTCTGTC GACGGGTCTC CTGCTTCTGC AGTTTAACAA GCACTTCAAC AAGCCTGTTT 1980
TTTCCCGCTT GGCAAGCCAA GCTGACGTGA CATGGGGGCG TGGCAGCATC GACGATTCTA 2040
TTTTTGGATT CGATAATCGA AATTGAGCAT AAATTTTGAT CGATTTCGAT TAAAAATCGA 2100
AATCGTGACA CCCCTCACAC AGTTTTGTTT TGTTAAATAA ATTAAATATG AAATTTATGT 2160
TTCAAAAATT ATCAACATGC TAATGTCATT TTTTACCCAC ACATTCAAAT TCACAACACT 2220
GACAACTGTA TATGTGACCA TGAACCGCAA GACCACACTG TAATAAAATA TACAGTATTA 2280
ATGGGATTTT TGGTTGCCAT TAAAATTTAC AAGTACATTT ACAATTAAGT AAATTAAACA 2340
ATTACAATGG CATTTAAAAA TGCAAGTAAT ACAGTAAAAA TGATTAGCGC ACTCCCAATT 2400
TAATGACTAT TGTGCCTTAA AACTACAGCA CAACTGTAAT TGCTAATTTA CAGTACAGTT 2460
GTACATTTTA CACAACCAAC AGTAAATTTT ACAGCATTAT TTTTACAGTG CAGTGTTACA 2520
TTGCACACTG TTTTTCAGCA TACCAAAAAG GTTTAAGTAT GACTTGT 2567