EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-30083 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr21:1010677-1012025 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr21:1010993-1011004TTAATTAAAAT-6.62
Lhx3MA0135.1chr21:1011000-1011013AAATTAATTTATT+6
ZNF384MA1125.1chr21:1011445-1011457TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
ACTGTGAACA TTTCATCAAT CTGTTCAACA TCATTTGGGA AATAATTAAA AAAGCAAAAT 60
AAATCGAAGG TGGATTAATA ATTCTGACTT TAATTGTACA TTTTATGACA TTATTTCCAT 120
GGTAGTTCAA CCTAAATGTA CTCTTAATCT AAATGAAAAT CAAGAAAGTA TATTTTGATG 180
AATTACACTG AAGTTTTATC CCAAATACAA AAGAAAAATT AATATTTAGC ATGAAAAAAA 240
GTTTTATTTT ACTTAACAAA TGGTACTGAG AGCATACTTT ACATGCAACA GATTATTTAT 300
ATTATTTAAA ATGGGTTTAA TTAAAATTAA TTTATTAAAT TTACATTGAA AAAGTTCTGT 360
ACTCTCGTCT GCCTGGATGT TGATCTACAC ATTTTATATA TATATATATA CATCTAAATA 420
ATATCTAAAA ATAATTCAAT ATAAAAACAC AATAAAATTT GAATAAAAAT CAAAAGAATG 480
AGTTTAATTT CACATTAAAA AATGATCTTT AATTTAATGC AAGTATTACA TCAAATTAAT 540
TTAATTCAAT GTTTATAAAG TTACTCACAA ACTTAAATGC ATAAATATGT TTATTAATAA 600
TATAGTAATC TGATACTATA CAACTGTGAT CTACTATAGC ACCAGCTATT TAAAAGTCTG 660
CATTAATCAT GTACGCTAAT TTAATACTCA TGTTTAAATA CATTGTAATA CATAAATGAA 720
TCAAATATTA CACATATTTA TTCAGAATAG TTTAATTTAT AATAAAGATT TTTTTTTTTA 780
CTCATTATTC AATCACAAAT TACTTTGTTT TCTAATGTAC AAATGTAGAT TTCTCTTAAA 840
CACCATCTGA GGATGCAGGA GATCAGCTAA TCTGTGTATA GATTAATGCA GCATGCAAAA 900
GCAGTCTATT ATCCTAAACA GCAGTGTATA GAGTATATCT GAGAGCAGCT GTAGCTGGAG 960
GAGCAGCTCT TACCTGCAGT GGAGTGTGTT TGAGCTGGTC TGAAGGGCTC TGAAGATCTG 1020
TGTGTGTGTG AGAGACTCTC TGAAAGCCCT TGAGTTGTTC TCATGACCGT CACGGGTTCA 1080
GCAGCAGCCA TTCAGAGCTG CTGTTTCTCC AGCATCAAAC CTGCAGCTGA CTGTCTGCTG 1140
ACTGCTGGAG CACTACACTA CACACTACTA CACTACACTA CAACACTACA GTACACTGAA 1200
TGCTGGAACT TCACACACTA CAATATACTA TAACCCTATA AAACTATACT ACACAACACT 1260
ATTAGACACT ACACTATAAC ACACTACACT ATACTACTAC ACTACACTGA CTGCTGGAGC 1320
AGAGCATCAT ACAGTACACT ACACCAGG 1348