EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-29856 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr20:51312052-51313570 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr20:51313531-51313550CAAACAGCAGGTGGCACTG+6.08
HOXB9MA1503.1chr20:51312498-51312508GTCGTAAAAT+6.02
HOXC10MA0905.1chr20:51312498-51312508GTCGTAAAAT+6.02
ONECUT3MA0757.1chr20:51312439-51312453GTTATTGATTATTA-6.07
SOX15MA1152.1chr20:51312313-51312323CTATTGTTTT+6.02
Sox11MA0869.1chr20:51312522-51312537AATTATTTCAGTGTT+6
Enhancer Sequence
AAAGACGCGA TCTGAGAGAA TCGCCGATGA GTCGCCGATG CCTGTGAGAT ATTTGGCGTG 60
CTGAATATCT GGAGCTGTCG GCGATTCAAA TCATGCCGTG TGAAATGAGT TTTGACTGAA 120
AATAACATCA GCGATCGCCT ACAGCCAATG AGAGAGCAGC TTTCACTTGT GTGTGCGTGT 180
GTGTATGAGT AAGGTGAAGC TGCAGGCCCG GAGACCCAAC TGCACGCTCA GACCTGCGCG 240
CACAGACTTG CACTTCCAGA CCTATTGTTT TCTCAGACAG TGCCCCACCT GCTGTTGGGT 300
TGGGTGAAGC AGCAGGTACG GAGACCCAAC TGCATGCTCA GAACAGCACT TTCTAGCAAG 360
TAGCAACATC AGAAACGCCA GTATAAGGTT ATTGATTATT AAAGCAATTC CTGAAAATGA 420
CCAGGTTTTA TAGCATAAAT CAATGTGTCG TAAAATATTA CACTAAAAAC AATTATTTCA 480
GTGTTCGATT TGATCAAAAT GAAAAGATAG CATTAGTTTA TGGTATTTAC AGCTTGCTCT 540
TATTATCGGT GTTATTGTAC CATTCTGGGA CACTTTTATA GCAATGTTTT CTGGCGAAAT 600
AAAAAACCTT AAAGTTAAAA TAAAATGTAT AATATATAAT GCAATTATTG TTTGTGACAT 660
ATTTAGTGCT ATGTAGGTCT ACTGTACATC TGTATTATCA ATCTGAAAGT GCAAACAAAG 720
ACAATAACAG TAACACAATA GCAGTTTATC AATTGATAAT AAGTTCTGTA ATGATTACAA 780
ATGCGTTTTT TGGAAATCAA AATATCAGCT ATTCTGCATA GAATTTACAA TATGAGCTCT 840
TAGGTTATAT CAAAAATAAT TAGCTTGTGA CTTGTGTATT TTTTTCCCAG ATTGCTATTA 900
CAATTCAAAA AGGGGGGTCA ACACTAATGC AGTGCACCAA ATGCTACAGA TATTTCCATT 960
TTTTTGCTCG AGAAATGAAA AATCTTCCCA ACAAGAATGT AAAGCATTTA TTTTATTTGA 1020
TGTTATTTTC TACGTAAAAA ATAATTATTA CTCCAATTAT TTTATTTCAC CATTTTTCTC 1080
TGCATTTTTT ACAGCTTGAT GACTTGTAGG ACCTAATGAA AAAGTACACT AAAATAAAGT 1140
TTGTTGTGAG AAAATTACTC CTACTACTAT AATTTATTGT ATGTGAAGAA ATGTATTGTA 1200
TATGAAGATA ATATTCATTT CCACATCTCA TTACGAAACA GTGATAAATC CTTAATGATT 1260
AAAAAGACAA CAACAAATGT CTGAAAATAT TGAAGTAACT GAACAATATC TATTTACAAA 1320
TAGAGTTAAT AAAAATACAA CAGAATTAAT GCATCAAATC AAAATCTAGT ATGTTTAATA 1380
TTTTGTATAA TAATGTGTTC AATCATAGCG TAATATTTTA TAGTAGAAAA ATAGTTTGTT 1440
ACAATTTAAA AGCAGCTGAA TTCAGGTTAG TCGATCTTTC AAACAGCAGG TGGCACTGTG 1500
AATGTCTGAA AGTGCAGG 1518