EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-29368 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr20:37243074-37245582 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr20:37244163-37244174ATAATTAATAT-6.02
ESR1MA0112.3chr20:37244910-37244927AAGGTCAAATTGACCCT-6.38
ESR1MA0112.3chr20:37244910-37244927AAGGTCAAATTGACCCT+6.4
HNF1AMA0046.2chr20:37243444-37243459TATTAATAATTAACA+7.18
HNF1BMA0153.2chr20:37243445-37243458ATTAATAATTAAC-6.92
IRF1MA0050.2chr20:37244670-37244691AAAACAAAAGTAAAACTGAAA-7.08
LMX1BMA0703.2chr20:37245182-37245193ATTTTAATTAA+6.62
POU6F1MA0628.1chr20:37243480-37243490ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:37243480-37243490ATTAATTAAT-6.02
POU6F2MA0793.1chr20:37245351-37245361AGCTCATTAT+6.02
PROP1MA0715.1chr20:37243272-37243283TAATTTGATTA-6.02
ZNF24MA1124.1chr20:37243612-37243625TATTCATTCATTT+6.42
ZNF384MA1125.1chr20:37243711-37243723AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr20:37243709-37243721ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr20:37243710-37243722TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr20:37243708-37243720AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
CAGGTGATGG AACTGTCAGA GAAGGGAAAC AACAAACCCA ATTCACCATC TCAGTGTGTT 60
GGTGAAGTGA ACAAATGTAT TATTCATCTG AAAATGTGGC AGTCAGAAGT TTGGGATGTT 120
TGAATGCTGG GTTCAAGTCA TTTTTAAAAG ACAGTGCCCC CCAAAATTAA AATTCAGCTT 180
TATTTACTCG CCTCAACCTA ATTTGATTAG ATTTATTCAA TAAAAATGAT AATAATAATA 240
ATAATAATAA TAATGATATT AATAATAATA ATAATAATTA TTATTGTTAT TATTATCCTA 300
ATGCATACTA TAATACATAT TATTAATAAT TATACAAATT TCATTTGACT ATATTTTTGA 360
TTAATATTAA TATTAATAAT TAACAACAAT TAATAATTAT TATATTATTA ATTAATAATA 420
CATGTATTTA ATTTTTTGAT TTAAGAAAAA AAATCTACTT ACTGTAAGTA GCAACAGGTC 480
AAAAGTCATT GGGGGAGGAA AAAATGCATA AGATGAATTA AAGTATATGT CACATTTTTA 540
TTCATTCATT TTCTTTTTGG CCTAATCCCT TTATTAATCT GGGGTCGCCT CAACAGAATG 600
TACCACCAAC TTTTCCAGCA TTATTTTAAA ATAAAATAAA AAAAAAAAAC TCAACAAAAA 660
GAAGAACCCA AAACAAATCC TTAAAATTCC ACAGAGTTCA GAGTATACAG CAAATAGAAA 720
CTGTAGTCGA AAAAAAAAAA TTATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT 780
ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAC ATATATATAT ATATACACTG TATAATAGAA 840
ATTATCATAA AAAGGGTTAT AACAAAAAGA TTACAACTCA TTTTCCTTGC CTTGTCTTCC 900
GTGCTTGAAC CTAGCTTTGT TTTGTTTGTT TTAAGTTGTC TGCTGCCTGC TTTTTGACCA 960
TCTGCCTGTT ATTTGTCTAT GATTCTGGAT TCCCAGTATA CATATGTTTG TCCAGAGCTT 1020
CACACAACAG CAGAAATACA TCTGTGGCTA TTTAAATGAC CATTTTGAAA ACTAGTCATA 1080
GTAATTATAA TAATTAATAT TATTATTCCG TCTCAACCAA TTGTTGCTTT ATCAAATGTT 1140
TAACAGAGAG CACAAGAACA GCAGAATCAG TTTGGGTAGC TTTACTGTTT TTATTGGCAA 1200
TTGCTCTTCA TAGTATCATT CTTTTTTTGT AAAACTACAA CAAAGAAGGG AAAAGTAAGT 1260
ATATATTCCC ATATACTTTC AACCAGCAGT AAAATGTACA TAGTTTTATA AGTAATCACA 1320
ATATGCATAT GAGGAAAATA TGTTAAATGA GACCATTTGA ATTAAATATT AGCAAAATTA 1380
TCATATTTTT ACACCACCAG CATAGCGTGT AAGCTATGAA GAAATGTTTT TTCAACAAAA 1440
TACGGGTGGT ATAAAACTGG TAATTATCAA ACAATCCTTG AATATTTACA AAAATAGTAA 1500
TAGTTTTAGT AAAAATGGAG CACTTACACA CATTTATTTT AACGTCAGCC CCAGAAATAA 1560
TCTGCTTGTG CGTTACTCTA GACCGCACAC TAAGAAAAAA CAAAAGTAAA ACTGAAATAC 1620
AGTATATAGT GCAGTACTTT AAATATTTAA TAGGTGGAGG GTCAAAACCC ACAAGTGGCT 1680
ATACATGACA GCACAATAAT GATAGTGATT CAAAAATATA TGTTTTGGGG GCCTGAATCT 1740
CGTTATACTT TGGACTTTAG TTGCGAGGTG AATAGTGGGT CGTTAAAGGC CCGCGGGCCA 1800
AAAGTTTGTG ACCCCTGCTG TAAACCATAA TATTACAAGG TCAAATTGAC CCTTGAACAT 1860
CACAGTAAAA AAACAAAAAA TGGTACAGCC ATTTCATAAG ATTTTTCATA AGATTTCATA 1920
AGAACAAAAA GCAAAGGTTA ACAGTTGAAA ATTTGAAACA GATCAATTTG ACCAGGAATA 1980
TAACTGAAAA CGGTGTCTAA TTTAGTTAAA ATCTAAATAT GTGCATACAG TAGCTTGCTT 2040
GCTTGACATG AAAACAGTTT GCCATACAAT ATAGCTTGCC TACTTATATT TCATAAAATA 2100
CACATGATAT TTTAATTAAT CTTCTTTGCT ATTTCATGGA CTTAAAACAG CATGCAGATT 2160
TTGATTGGCA TGAGGGTTAG TAAATAAAGA CATAAAATCA TACATTTATA TGGAGTATCT 2220
CTTTAAGGCT TGTGGGTCTG ATGTAGCATT GGAGATTTCT GGAGCCCTTC TCTGCTGAGC 2280
TCATTATAAA GTCTTTTTCT GCCCAAATGA ATGACTAATG CATTGATAAC ATGTGGGCTA 2340
ATGCTTGAAT GTGGCAGGCG GCCTGTCACT GCTCCTTGTC AGAGGACGTA ATTGGACTTT 2400
CATAAACAGT GAAAGCTTTG GGAGAGAGAT GGCAGCGGGC AGCACTCTCT GATCACTGAT 2460
CAGTTTGCTC TCATTGTCCG TGTGATGGAC GGCTTCTTTA CTTCAGCC 2508