EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-29193 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr20:33430529-33431479 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr20:33430617-33430628GAGCCATAAAA+6.14
RXRGMA0856.1chr20:33431400-33431414TCAACTTTGACCTC-6.18
RarbMA0857.1chr20:33431031-33431047CAGGGTCAAGAGGTGA+6.16
RargMA0859.1chr20:33431032-33431048AGGGTCAAGAGGTGAC+6.09
Stat4MA0518.1chr20:33431077-33431091TTATTTCCTGGAAG-6.57
Enhancer Sequence
CATGGTTTAT TACGTTGATC TGCAGCAGCA CCTCCGACCG GCTCGAGTGT GGATCATACA 60
TGGTAACTAA TCCCAGACTC TCACTCTTGA GCCATAAAAC CATACTTCCG CTCACTAACC 120
CTGAATCACT CGCTTGCTTT GTTGACGCGT ACCTGTTGAT GATGCGGTTC AAGCACAAAA 180
AAGCAACTAT GAAACAAGGA TTAGACGTAG CTTGTGTCTA TAACACGAGA TTTACCGAGA 240
GCGGCGTTTG TGTGTCAGAA TTGGAGGCAT GTGTTGGTGC AGCGATGGGG CGGGTTTATG 300
GTCGCTGCGA GCGTTTGATG TGCTGTAATG AGGAAGTGAG TGACTTCCTG TGGTTAACGG 360
GAGCGAGAGA GATGGATGAC GGGGGAGGCC GTAAATGAAA AGCAGCAGTA GCGCAGTTAA 420
CAGAGGCCGG GGTGTGCGGG TTAAACGTTT TTCAAATGTT TTAACTGCGT TCTCTCCGAC 480
ACGACGGGGG GCGAGGATAT GTCAGGGTCA AGAGGTGACA GGCGAGATGT GTGCACTTCT 540
ACATGTCATT ATTTCCTGGA AGATGGGGTG CACTTGGTTT AGTTATGCGG GCCTGGATCC 600
AGATGGCTGT AGTTGGAAAC TTTTGGAGTC CATTTAACTT TTACTGTCAT CGTAAGCTTT 660
GTGTTGAGTT CACGGGCTTT GAGATGCCAA AGATGGAAGT GTTCAAGCGC TTAAGATACA 720
ATTTAAAGGT AAATATGAAT TTATATGAAT GGTATTAAGT TCCAGGTTCC TGAAATTTTC 780
AAAAAATGCC GCGCCATCTC ATTGGTTGCT GTCAAGAGAG CCCAATCATT ATCGTCTTGC 840
CTGAACACCG TTTGCTTTTG TATGTGTCAT TTCAACTTTG ACCTCTCTGT TGGGAGCTGT 900
GACCTTTCAG CAGGCCCACA CAGAATCATC ACAACTCCTT GGCCCTTGTG 950