EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-28830 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr20:27599146-27600593 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXC12MA0906.1chr20:27600023-27600034TTTTTACGACT-6.02
HOXD11MA0908.1chr20:27600023-27600033TTTTTACGAC-6.02
HOXD12MA0873.1chr20:27600023-27600034TTTTTACGACT-6.62
NR4A1MA1112.2chr20:27599598-27599608GTGACCTTTA-6.02
NR4A1MA1112.2chr20:27599886-27599896GTGACCTTTA-6.02
Enhancer Sequence
TTTTTTGTGC GAAATATATG TGTCTTAATA GTGTTTTTAG CAATGTGGGA CATAAATATG 60
ACTGTCAACA TCTCAAAAAA TGTGTTTTGA TGTTTCGTGA CCCTTTCATG TTGAGGACAC 120
CCTTAAATAT GTACACTCCA GAGGACATTA GACGCAGATT CAGTGTTATT AATATATACA 180
TACATGGTTT TAATTTGCAA ATAATGCAAA TATTACAAAT GTAAACATTA GCTAAGAAGC 240
ATAACATATA AGGCTTGGTT GCCTTAGAGG CAGAGGGGCC GGGTGAAAAA AACTCTTTCC 300
AATATTTTGC ATTTGGACTA CAATCCTACA ATCCTGCACC TTTAATTTTA TCAAGAAGTA 360
GACTTTTTGT GTTCTCCTAT TGGCAATTCA ATTCCTTGTG TCAGCGAATC AAGGCCTTAA 420
ATTTAGCAAG ACTGAAGTCT TCTGCAACTT CTGTGACCTT TAGCCTTAGC TGTTTTCCTT 480
ACAGCTCAGG TTGTTGTGAC AGTTTCCAAT CCTCTCATCT GTTTAAAAGC GGCAGTCTAG 540
TAAACACGCC AGAGGGAGAG TAAAAACAGA TGTAGACGCT CACATATTCA CCCACAGGTT 600
TGCCTCAGAG GTTTCTGGTA TTAGGATGTT TATTTCTTAT ATTTTCTGAC ATGGCACAGC 660
ATAACCTTAA GCGAAGCGTT GAGCACTCAG GCCTTTTGAT AGAGTGATAT TTACACTCAT 720
CACCTGCAAT CAACAACCCT GTGACCTTTA GGATCTCAGC AGATCAGTGA TATGTTTTAT 780
AGCAAACATA TACGTGTCGT TTATTGTGTG TGTGATATAC TTCACATCAT GCATGCTGCT 840
GAGGTGTGCA AAAAAGCAAG TACCAGGAAC AAGTGGGTTT TTACGACTGA AGGCCAGCTG 900
TAATCTTGCC TTTAAAGATT TACAGATAAA AGCAGAGTGG CTTCTCTATT CCCGTAGATG 960
GGGAGCGTCT CTCTGTGGCT TTGATGTCGC TTTGTGGCCG AGGGTCTCTC TCATGTGCTT 1020
TTCCGTAGGC TTTCATCGGC ACGCTGAGTG TGTATTATCT GCCGGAGTCA TGCACCGCAT 1080
TATTGTGCTG CTGACTGCTG TGCTGAAATG CATAATCGTC AGAGAACAAC AGAGCTGACA 1140
CCTGTTTGCC CTGACTGAAA GTGCTCGTAA TAAATGCAGA CGCTGGAAAA TGCATCATGT 1200
AACTGATGTG GCAGAACACA CAGTTCTGCT TTTAACAAGC TCTTTAAACA CAAGCTTTTA 1260
GGTTTGACAA CAACCCCTTT CTCTTTGTGT GCGATACTAT ATATGCACTT TGTAGAAATG 1320
TGTCAGCTTA TTGTGGGAAG GAAAAGTTAC AACCTGCAAA ACTTCCTAAA AAACAAAAGC 1380
TCGTATGTAA ATTAGTTGCG ATTGTGCATT GAAGCTTCAA TACGAAATTC TGGGCAACAG 1440
GATTTAC 1447