EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-28325 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr20:19076945-19077989 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hmx2MA0897.1chr20:19077897-19077914AGAACCAATTAAAACAT+6.99
Hmx3MA0898.1chr20:19077897-19077914AGAACCAATTAAAACAT+6.61
RFX1MA0509.2chr20:19077014-19077030CGTTGCCATAATAACC+6.83
RFX1MA0509.2chr20:19077014-19077030CGTTGCCATAATAACC-6.84
RFX2MA0600.2chr20:19077014-19077030CGTTGCCATAATAACC-6.71
RFX2MA0600.2chr20:19077014-19077030CGTTGCCATAATAACC+6.81
RFX3MA0798.1chr20:19077014-19077030CGTTGCCATAATAACC-6.31
RFX3MA0798.1chr20:19077014-19077030CGTTGCCATAATAACC+6.73
RFX4MA0799.1chr20:19077014-19077030CGTTGCCATAATAACC+6.32
RFX4MA0799.1chr20:19077014-19077030CGTTGCCATAATAACC-6.35
RFX5MA0510.2chr20:19077014-19077030CGTTGCCATAATAACC-6.34
RFX5MA0510.2chr20:19077014-19077030CGTTGCCATAATAACC+6.74
SRFMA0083.3chr20:19077925-19077941TGACCAAATATGGAAA-6.1
SRFMA0083.3chr20:19077925-19077941TGACCAAATATGGAAA+6.45
Enhancer Sequence
TATTTTAAGG TCAAAATTAT TAACCCCTTT AAGCTATTTT CTTTTTCAAT AGTCTGCAAA 60
ACAAACCATC GTTGCCATAA TAACCCTAAC CTGTCTAGTT AACCTAATTA ACCTAGTTAA 120
GCCTTTAAAT GTCACTTTAA GCTGTATAGA AGTGTCTTGA AAAAATATGT AGTAAAATAC 180
TATTTACTGT CATCATGGCA AAGATAAAAT AAATCAGTTA TTAGAGATGA GTTATAAAAA 240
CTATTATGTT CAGAAATGTG TTGAAAAAAA TCTCTCCGTT AAACAGAAAT TAGAGAAAAA 300
AATAAACAAG TGGGCAAATA ATTTAGGGTG GTTAATATTT CTGACTTCAA CTGTATATAT 360
GAGTTCCAGC ACATGCAGGT TTTGAACGTA AATATGTGAA TGTTATGCTT CACAATACAG 420
ATAATCTAGG ATGTGTTTAC TTATGCTGCC TGAAGGGGGA AGTCACGTGT TGTTTGGTGA 480
TGTGGCTGTT GCTGCAGGGC CGTTTCGGAC GTGACAGATT CTTAAAGAAT GTGTGGGACT 540
GTAAGATCAT GTGTTTTGAG ATGACCACAA AGGCATGTTA TTATTTTTCC ATCACATGCT 600
GAAGTGGAAC ATATTATATA TCTTACACAG TAATAACAAA CTTTCCCTTG CATTGTTGAA 660
CAAAAATGTG TATATATATA CCTTTAAACA ATGTAAGAGA CCAATTAAAT ATTCTCAGTT 720
TTCTGATTTA TATTTATGTG TTTGCTTATA TCATCATTTT TATTTTATAC TGTAAGCTGC 780
TGATGACATT TGTTTAAAAT TTAAAATAAA AAATGTAATC TTTTATAATT ATTTTATAGC 840
GTTTGTTCGC ACAAAAGAAC ATTTTAGTCA TTTTTAAACA ACAGAATGCC AAACAAAACT 900
GCAAAAGAGT AAAAAAAATC TGTATTTGGT AGAATAGCCT TGATTTTCAG TTAGAACCAA 960
TTAAAACATT ATTATTATTT TGACCAAATA TGGAAAAAAT GAAAATTTTA AACCAATTAA 1020
ATGTAGTAAT ATAAAGTAAA ATAG 1044