EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-28108 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr20:10314490-10315946 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr20:10315547-10315558GGTCATAAAAC+6.02
CDX4MA1473.1chr20:10315547-10315558GGTCATAAAAC+6.02
FOXC2MA0846.1chr20:10315432-10315444ATTGTTTACATT-6.32
Foxj3MA0851.1chr20:10315429-10315446ACGATTGTTTACATTTT-6.21
IRF5MA1420.1chr20:10314832-10314846CCGATACCGATACT+6.46
SOX4MA0867.2chr20:10315539-10315549GAACAAAGGG+6.02
Enhancer Sequence
CAGCTGCAAT ACTTTTACTC AGATAGCAAA ATTCATGTGG CTCAAATCCG GCCCACACCA 60
GACACATATC CGGATCACAG ACCGCATGGA ATGATGGCAC TTGGGCAGTC TGCTCCTGCT 120
TGCCAGATCT GTGGCACAAT TAAGCCACAG CAATACCATA TATCAGCCCA AATTCAACCA 180
AATGAAGCAG AACGTACTCT GTTCTTGGCC ACAGTTTGCT TTTATTCTGA CCCAGATCTG 240
ACCTACACCA GAAACTTACA TCTAGACTAT AAACTGAATG GAATGATGGC TCTAGGGTGG 300
TCTGCTCCTG TTTGCCAGAT CTGGGTCACA AATTAGCTAC TACCGATACC GATACTACCG 360
ATATCTGCCA TGTCAAAGAC CTATGGTTTG ACCCTATAAT TATCAAATGA TCGCTGTACT 420
TTATCTTTCT CAAAAGTGAC CAATCAAAAA AGTGGTCGGC ATATGTTATA ACTAGGCCAT 480
ATTTGCCATA TCTTCTCTGA GCCACTTCAG GCTCAAAGTT ACATTAGCCG AAGCTTACTG 540
TGCCAAATAT TTGTCAAAAG TGGTTGACTT ACTTTTTGAG GTAACGGGGC CACATTTGAC 600
ATATCTTCTC TGGACCACTT AAGCACCAAA TTCTGCAAAT AACAGGCTGA ATGGTCAGTT 660
GTAATCTGAT TCCAAGGTAT TTATGACCCA AAGGAATGTG CTCACAGCAC AGCACAAAAG 720
AACTGAACAG GACTATAAGC TTCTTGCTTA AGACTAATGT TTTAATGTAA ACTTTATTCT 780
CTCTTTAGTG TAATCATGTG TTTTGCAACA TTTCCCTTAC TCCTGTATTA ATATTATGGT 840
TTTAATACTT CGGCATGCAA TGTTTAACTC TACTGAAGCT AAACAAGCTC ATAAACAGTT 900
CATGTTTGAA GTCATTTGGA AGCTAATTTG GTGTACTGAA CGATTGTTTA CATTTTATGT 960
TAAAGAGTGC TACATATTAA TATTTAAGAG ACTTGGACAT TTTTGGATCA GTTTGCATCA 1020
AAATGCCTAT GCAAATCTCC TTATACTTCG AACAAAGGGT CATAAAACAT GTCTCAAGGA 1080
AGTAAGTTTC CGATTGGTCA ACTTGGAAGA CCATGGAGGG TGAATACGAA CCCTCCCTAT 1140
AAAGCTTGTG TCCAAAGCAA GTTAAGTTGA GTGAAGTTAA GGTTAAAACA AGTCATAGCA 1200
ACGCCCTAAG AAAGAGACCT AAGCAGAGAA ACCTCCAAGA AAGCAGAGAC CCAGAAACCT 1260
CGGGCTGTTG AAAGGCTTGA ACCCAGAGGA CTCCAGGGAG CAGGCGGGTA CCCAGACGAA 1320
ATGGGTTAAT CGCACAGCTC AGACATTCAC ATCTCTGATA CCTTCTTTTC ATCATTTTCT 1380
ATCGAGAGTC TAGTTAAGTT TAGTGCGCTG CAAACCAGTA GCCATCACGA CTGGCCCGTT 1440
GCCGCTTCAA CTTAAA 1456