EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-27707 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr2:58893670-58894116 
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr2:58893959-58893974TGACCTTTGACCTCA-6.55
NR2C2MA0504.1chr2:58893952-58893967TAACCTTTGACCTTT-6.27
NR2C2MA0504.1chr2:58893959-58893974TGACCTTTGACCTCA-7.73
NR2C2MA0504.1chr2:58893938-58893953TGACCTCTGACCCCT-9.03
NR2F1MA0017.2chr2:58893955-58893968CCTTTGACCTTTG-7.22
NR2F2MA1111.1chr2:58893957-58893968TTTGACCTTTG-6.62
Nr2f6MA0677.1chr2:58893938-58893952TGACCTCTGACCCC-7.03
Nr2f6MA0677.1chr2:58893952-58893966TAACCTTTGACCTT-7.22
Nr2f6MA0677.1chr2:58893959-58893973TGACCTTTGACCTC-8.42
RARA(var.2)MA0730.1chr2:58893966-58893983TGACCTCAGGGTGAGCT-6.02
RXRBMA0855.1chr2:58893952-58893966TAACCTTTGACCTT-6.64
RXRBMA0855.1chr2:58893938-58893952TGACCTCTGACCCC-7.06
RXRBMA0855.1chr2:58893959-58893973TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRGMA0856.1chr2:58893952-58893966TAACCTTTGACCTT-6.8
RXRGMA0856.1chr2:58893938-58893952TGACCTCTGACCCC-7.01
RXRGMA0856.1chr2:58893959-58893973TGACCTTTGACCTC-8.12
Rarb(var.2)MA0858.1chr2:58893966-58893983TGACCTCAGGGTGAGCT-6.55
RxraMA0512.2chr2:58893952-58893966TAACCTTTGACCTT-6.86
RxraMA0512.2chr2:58893938-58893952TGACCTCTGACCCC-6.98
RxraMA0512.2chr2:58893959-58893973TGACCTTTGACCTC-8.12
TCF7L1MA1421.1chr2:58893955-58893967CCTTTGACCTTT-6.22
Enhancer Sequence
CACACTCACA CACAGACGCA TGCACACACA CGCATGTACA CTCACACATA GACTCACATG 60
CATGCACGCA CACACACACT CACACACAGA CGCATGCCCA CACATGCATG TACACTCACA 120
CATAGACTCA CATGCATGCA CGCACACACT CACACACACA TGTACGTACA CTCACATGTA 180
AACTCACTCA CATACACACA CAGACACACA CACACACACA CGTCCTGTGC ATCTGTAGTC 240
AGACTGATGC TCTGCTGAGG CTGTGCTGTG ACCTCTGACC CCTAACCTTT GACCTTTGAC 300
CTCAGGGTGA GCTCAGCTGT TAATGAACTT CTGCTGCTCT GCTGCCTTCA ATAATTGATC 360
AGATGATGAT CATGTCCAGC TCACAGGCAA GAGTTAGCAT TCAGCACAGC ACTCTCAGAC 420
CTGCACTGAG TATCACACAC ACACAC 446