EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-27373 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr2:46484606-46485866 
TF binding sites/motifs
Number: 22             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF6MA1466.1chr2:46485001-46485015TGATGACGTGTCAA+6.79
Alx1MA0854.1chr2:46485220-46485237TGAATTAATTAATTAAT+7.27
ArxMA0874.1chr2:46485219-46485236ATGAATTAATTAATTAA+6.04
ArxMA0874.1chr2:46485220-46485237TGAATTAATTAATTAAT-6.7
CREB3MA0638.1chr2:46485001-46485015TGATGACGTGTCAA-6.7
CREB3L1MA0839.1chr2:46485001-46485015TGATGACGTGTCAA-6.32
Gfi1bMA0483.1chr2:46485113-46485124GGCTGTGATTT-6.02
Lhx3MA0135.1chr2:46485225-46485238TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr2:46485221-46485234GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr2:46485222-46485235AATTAATTAATTA-6.78
NR2C2MA0504.1chr2:46485123-46485138TGAGGTCAAGGGTCA+6.61
Nr2f6MA0677.1chr2:46485124-46485138GAGGTCAAGGGTCA+7.12
POU6F1MA0628.1chr2:46485223-46485233ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:46485227-46485237ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:46485223-46485233ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr2:46485227-46485237ATTAATTAAT-6.02
RXRBMA0855.1chr2:46485124-46485138GAGGTCAAGGGTCA+7.01
RXRGMA0856.1chr2:46485124-46485138GAGGTCAAGGGTCA+7.04
RxraMA0512.2chr2:46485124-46485138GAGGTCAAGGGTCA+7.01
XBP1MA0844.1chr2:46485002-46485016GATGACGTGTCAAG-6.01
ZNF384MA1125.1chr2:46485274-46485286TTTTTTTTTTAT-6.27
ZNF384MA1125.1chr2:46485275-46485287TTTTTTTTTATT-6.62
Enhancer Sequence
GTGTTTTACT GTCATACTTT TTAAAACAAA TGCTGAAATA AAAAACGCAA AATTTCGCAA 60
TCAATAATCC ATAATAATAA CCCCTGTATA GCAATCCCAC AACATACATA TCATATCTGG 120
CACTCAATTA CACTTTAATA CCCTTTCAGA AAAGTCTGGT GGCTGGGAAG GACCTTTTTA 180
CAGTGTCTAC TATAATGTTA TTGTTGTTTT GGTGTGTTTA CATGGTTGAA TATGGCCACT 240
GTGTAAATGC ACAGTACTGT TAGATCGTCA TGATAACATG ATATCCTGGC CTTTAGTGAT 300
TTCCTGAAGA TAAATACCAA AAAATTACGC AACTGGAATC ACTACAGAAG TTGCAGTTGT 360
TTATCTCATA TGAAGCAAGA GATCGCAATG ACATATGATG ACGTGTCAAG GTGCTGTCCC 420
ATTTCTTAGG GGTAAATTTA AAGACTTTCC ACTTCACACT TCACACTAGG GACAATGGGG 480
AAGGGGAACA AAATAGAATT GAGATTGGGC TGTGATTTGA GGTCAAGGGT CACTTTTATA 540
TTGTGTAATA ATAATAATAG CAATAATAAT AGGCAGTGCA TTACTCTGTG GCGACCCATT 600
GATAAATAAT TGAATGAATT AATTAATTAA TAATAATAAT AATAATAATA ATAATAATAA 660
ACAAAAAGTT TTTTTTTTAT TTAATTTTAA AAAAATAAGT TTTTGTCCGT CATGTGTCTG 720
TAGTGATTTC TGTCCCTTTA ACTATTGCTT TTTATTCTTT TTTTGCTAGA CGTTTTAACA 780
TCAGCAATAT ATTAAATGGC AGGTCAATTT GTAGTGCTTT AGATGGCCTG AAAGTACTCC 840
GTGAAATGCG TATAGACATT TTGATCCATC ACGGGGACTT TATTTCCCTG TTTCTGCTAT 900
CATACTTGAA ATCGTTATGA ACTCCACTCC GCTTTTATTC CTCATTCGTG GTCAGAGGGT 960
AGCGGGGCAG ATGGAGGGCA AGGGAAGCTG CTTTGCGCGT TTGTTCTACT AAAGGCTCTA 1020
GGTGCTTCGG GTGACAATTT TCCAGATCGA AGCGAGCAGC GCAAGGCTAA ACCGCTTGAC 1080
ACATTGATGG CACGACGCCC TCGACGCTTG ATTTACACTG ACTGCAAATG GGCCTGAGCG 1140
ATCGGAAGCT TGTAGAGGAA GATCTACTGC GGCGGGATGA GTCGTGTGTC TGCAGTCAGG 1200
AGTTATAGCT GTTTGTCTTT GACATATGTA ACTTTTCCTC GGTAGCTCTC TGACATTCTT 1260