EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-27205 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr2:42397095-42398382 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr2:42397220-42397230AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr2:42397220-42397230AACAGCTGTT-6.02
MSCMA0665.1chr2:42397220-42397230AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr2:42397220-42397230AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr2:42397220-42397230AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr2:42397220-42397230AACAGCTGTT-6.02
Sox11MA0869.1chr2:42397860-42397875CACACTGAAATTGTG-6.39
Tcf21MA0832.1chr2:42397218-42397232TGAACAGCTGTTTT-6.01
ZIC1MA0696.1chr2:42397144-42397158TACCCCCTGCTGTG+7.42
ZIC3MA0697.1chr2:42397144-42397159TACCCCCTGCTGTGG+6.39
ZIC4MA0751.1chr2:42397144-42397159TACCCCCTGCTGTGG+6.26
Enhancer Sequence
TCAAGAAAGG GGGGCTTGAG GTGGAAGGAG AAGGGTGACT TTCTCGCATT ACCCCCTGCT 60
GTGGTGTAGC TCTGTTTTTC CAGCCTGTGT TTGCATTGTC AACAGTGATT TGAATAGAAC 120
AGTTGAACAG CTGTTTTCTT CATCACTTCT CAGATTAGAA AGTGCATTGA AGCATTCCAT 180
CTTGTCTCAT GAAATTCCAT AACAGTTCTC AGGGTCTGAT ATTTTGGAAT CTTACATCTG 240
CCCGCCCTCA TCAGACTATA TCCACACCCC CTGTTCCCAT CCCCTGTGGC AATGTTGTGT 300
CTTGTCTTTG TGTTTATGTG CTGTTGCTGG GCTTTTTTTC CCTCCCATGG TCTCACATTG 360
CCCTAATTCA AGGGCAAGGT GTAAGGGAGT TTTTTTTGCC TCCCTCTTCT GAAATGTATC 420
TTATTTCCTT TTTTTAAGAG CTACCTCCTG TGACCTGTCT TCCCCTGAAA ATTGTGATGC 480
TTGTGTATGA GCGGAGGGGT TCAATTTCAC TATACGAAAG TGTATGTGAC AAATAATGGC 540
CTGATTTGAT CTCAATTTGA TTTGAGTGGT ATTACATTAA CCGATGTCTC ACATTGCCCC 600
ATTCTCTCCA ATGTGTTTCT GTTTTTTTCC AACAGCGCCC TTTTCTTGCG CTTACTATAT 660
TCTATTTAGT AAGTTTATAT TTCATTAGTC TTTAAATGTT TGTGGGTTAT GTTAGCTAAA 720
AGAGATGTAA CACAATAGTT AGATAAATAT TATTGGGATC ACCTTCACAC TGAAATTGTG 780
AAATCTGAAA ATTAATTCAA CTTCTATCTC TCGGTCTCTC AATGAAAAAC AAAAGCTCGT 840
AGTCAAATGT AAAATTCATA ATAAACTTTT TTTTTGTTCA ACGATAAATG ATAAACATGC 900
ATTATATGAA TAAAAATTTT ATATGCAGCA CTATTTGAAG CGTTTCTCTG GCTACAGTTT 960
CATCTCTGTT AGTCCTCCTT CAGTTCAGTA ATTATGAAAC TTCCTTTTCC GTCTGCTCGG 1020
CTTACGACTT TACTTTCTGT TTTAACATGT CTGACTCGAG TAAAATGGCA GCTGAATCCA 1080
GTGTTTCTTT CGCTCAGGAT CAGTTCAACT GTTCAATATG TCTGGATCTA CTGAAGGATC 1140
CAGTGGCCAT TCCCTGTGGA CACAGTTACT GTATGAGCTG TATTTCAGAC TATTGGGATC 1200
AGGATGAGTG GAGAGGAGTC TACAGCTGCC CTCAGTGCAG ACAGACCTTC ACTCCAAGAC 1260
CTGCTTTAGG GAAAAACACC ATGCTGA 1287