EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-25697 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr2:4329237-4331677 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYAMA0060.3chr2:4329264-4329275TCTGATTGGCT-6.32
Nkx3-2MA0122.3chr2:4329549-4329562TTTAAGTGTTTTT-6.64
Nkx3-2MA0122.3chr2:4329692-4329705TTTAAGTGTTTTT-6.64
POU4F3MA0791.1chr2:4331357-4331373ATTAATTATTAATAAA+6.06
POU4F3MA0791.1chr2:4331354-4331370TTGATTAATTATTAAT-6.34
RUNX3MA0684.1chr2:4330221-4330231AAACCGCAAA+6.02
ZNF384MA1125.1chr2:4329764-4329776TTTTTTTTTTAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr2:4329765-4329777TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
TCTAGCTGAT GTATTTGCAT ACAGTGATCT GATTGGCTGA CGCTTCCGTC TGCGCTTGAA 60
AAGTTGAGCT AGTCCTGCAG CGAGCAACAC CTCTGAAGCG GCACCAACGG ATCCACAATG 120
CAGTTCGGCA ATGCCTGACG TCACCCATTC AAAGTGAATG GGAAGCGTTG ACGCTGACGC 180
GTAGTAGTGA CATGTTTTCA TTAATAAATT TGAGCAAATG GTGGTTAATT TCCTTAAATT 240
ATAAAAGCAC ATCCCACTAA CAATATTAAA ATCATATATC ACTAAAAAAA ACCTAGTAAT 300
TTTCATGATT CTTTTAAGTG TTTTTTGCTT AAAAAAAATA CTAATAATTT GAGTAAATGG 360
TTGTGGATTT GTATAAATTA TAAAAGCACA TTCCACTTAT AATATTAAAT TCATTATCTA 420
TCACTCAGAA TCTTTTGTAA TTTTCACTTG ATTTATTTAA GTGTTTTTGC TTAAAAAAAT 480
ATAGTTTTGA AACTACTTAA AAATACTGCG TGCAATAGTG TTACCACTTT TTTTTTTAAA 540
GTAAATAGCA CATCATATTT GTTACAGTGT AGGCTAAAAT ATGAGGCTAA ATAGAACATT 600
TAAATTCATC CAGTGGAACC TCAAGAAGGT ATTTCGGTGT GTATCTATTA TTATTATTGT 660
TTACAATATT ACCCTGAAAA GCTGCTCTCT GAGCTCGTGA ACTCTGGATA GTGTGTTCGG 720
GGGATGCCGT CGTTATCAAC AGGCCTGTGG TAGAGCTGGA GCCTCCGGGC CGCCATTTAC 780
AGTGCAAATG TTATCGTTCC AATGACACTT TAAACAGTCT TTATCAATAT ATAGTCATTC 840
AAGGTTTATG AGCTTTGATA AAAAGACGAC AAAAAGCGCC ACTAGCCTAG CAGGGTCATG 900
CTAACCCTCC CTCAGTTCCT CAGTTTCTGA TGCTCGCCTC AAAATCGAGT ACAATCTGAA 960
GCGGCAGACA AAACACGAGC ACAAAAACCG CAAAACATAT TGACTGGTGA CGCGAGGGTG 1020
AGTGATAATG CGCCTCCAGC AGAATCTTAT CACGCTATTA TCTTTAAAAC GTCGGGTTAT 1080
CATAATTGCT TACTTAATAA TTCTATAAAA GCTCCTTGAG CTCAACCTTT GGCTGGGCTG 1140
TAAAACAAGT TGCAAGAACT TTTGATTTCG CGATTGGAGA CGATACCCGT TTTGTCAGCC 1200
TGTAGGCTGT GTCATTCATC AAAACTTCCC TTCAACTCTC CTCCATTTTC TCTCTTCTCT 1260
CTTTTTTCGG TTCACTGTGA TCACGCAGAG CTGCTTCAGC CACAGATAAG CTTTAAAGTA 1320
GTGACTGATG ATATATTTAG CCCACATTAG CTGCTAGCAA ATGCTTTAGC ACTGTTTTTG 1380
CTTCTTTGTA ATGCACCTGT CAGGTTTGTT TTCGATGGAT GTGAAGAAAA CATTATTTAA 1440
ATTGCATTTG ATCAATATGT GTTCGTAGAA TTTAATTGAA ATACACATTT GAAATGAGTT 1500
TTTCTCATAT AAATCTCCCC TGCAGCAGTG TTTATGTATT TTGTTTAATG TTAAATCGCT 1560
GACTGTATTC TGAAGGTTTT TACAGAAGGA CGTGTTCAGG ATTCGCCTGA TTATATACAA 1620
CATTTTATAC TGCAAAATGG CTATTACTTT AATTCAATAC AATTCAAAAG AGCTGGAATA 1680
ACTTGGTTAA TGTTGCCAAA TATTTGCAGA TATGAAGTGT AAAGTGATTA TAATATACAT 1740
ACGGAAAAAA ACAACACAAT TAGGCTAGAA TTTTGTAAAA AAACAAATAT ATGATCAATT 1800
AGTAATACAA CTAAAAATGA AAAATAATGC CTCCTTTTTG TATTTAAGCA TAACATTTGA 1860
GAAAACTTGA AATACTGTTG TACAATTTTT AATGTAATCA TTCAACTGTA GAGTGCATGT 1920
GGTAATAAGT ATTTTTTTCC TCTATTCATC TGCAGTGTTT TGCCCCAAGT ACTAATGGAT 1980
TTGGGATTGG GATTATCATC AATATTTTTA ATTTAATTTA ATTTAATTTA ATTTAATTTA 2040
ATTTAATTTT AACAATTAAG CTAAAATAAG GGGATAAATT CTAAATATAT AAATATATAC 2100
AATTATTAAA AATTGAATTG ATTAATTATT AATAAAATTT TATTTATTAG TTTAAATTAA 2160
CAATTATTAT TAAAATTATT AAGTAATTAG AACTTATAAA ATGTTTAAAG CTAAATTAAG 2220
GAATAACTAA ATAAAGTAAA ATACAACTAT AATTAAAATA AAACAAAACA AAATAAAATA 2280
AAACAAATTA AATTAAACCA AATTAAAATT AAAACAAGCA AAACAAAATA ATTAAAATAA 2340
AATATATAAA ACAAAACAAA ATAAAATAAA TAAAATGAAA TAGAATTAAA AATAAATAAA 2400
AATACAAAAT AAAATATAAA CAAATAAAAT AAAACAAAAT 2440