EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-25499 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr19:48570620-48571901 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr19:48571301-48571312AAGCAATAAAA+6.32
HOXD9MA0913.2chr19:48571303-48571313GCAATAAAAC+6.02
LMX1BMA0703.2chr19:48571796-48571807TTAATTAAATT-6.32
NKX2-5MA0063.2chr19:48571829-48571839CTCAAGTGGT-6.02
NR2C2MA0504.1chr19:48570732-48570747GCAGGTCAAAGGTCA+7.16
NR2F2MA1111.1chr19:48570738-48570749CAAAGGTCAGA+6.14
NRLMA0842.2chr19:48570668-48570681GAATCTGCTGACG+6.2
Nkx3-2MA0122.3chr19:48570919-48570932AAAAACACTTAAA+6.64
Nr2f6MA0677.1chr19:48570733-48570747CAGGTCAAAGGTCA+7.73
PHOX2AMA0713.1chr19:48571797-48571808TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr19:48571797-48571808TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr19:48571797-48571808TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr19:48571797-48571808TAATTAAATTA-6.62
RXRBMA0855.1chr19:48570733-48570747CAGGTCAAAGGTCA+7.31
RXRGMA0856.1chr19:48570733-48570747CAGGTCAAAGGTCA+7.52
RxraMA0512.2chr19:48570733-48570747CAGGTCAAAGGTCA+7.58
Enhancer Sequence
GCAGATCTGT AACGGAGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTTTCC ACAGAGCTGA ATCTGCTGAC 60
GGAGACATTC AGGATGGAGA AGAGCAGAAT AAACACAAGA CGGCTCTGTT CGGCAGGTCA 120
AAGGTCAGAG AGATGCACAC CTGTACCTGT GTGGGAGTGT GCCGTATTTA TTCTCTTATT 180
ATTTAATGGT ATTTAGCAAG AACAAATACA TAGGAGGGAT GCACAATATG TCACTTATGC 240
ATCGATATTG CAATATGCAC ATCTACAAAT TAATACATCA CAGAACAGGA GCCACTTTTA 300
AAAACACTTA AACTTAGATT TAAAAAAGTG TGTTGTTTTT TTATTAAGGG TCTTAAGGCG 360
TTAATGGTCT TTTAATTAAG GGTCTTTTAT TAAGGGTTTG CGTGTTTTAT TAAGGGTCTG 420
AGACTGTATG AGCATTTCAA GTCAGTTTAA AGCATAAGAT ATACAGATAT GAGACATTAG 480
ATATTATACT TCTAACTTTT AAGAGAGCAC AAATATTGAG GACCTGGAGT GCCATTTAGA 540
AATAAAAGGA AACATATGTA ATGATTTATT TAATAAGTGA AGCCTTACAA TAAATATAAA 600
TAAATCACAA TTTAAATGGA CAAGTGAATA GACATATTTA AATGTGTTTT GTTAAACTGT 660
GTTTTTAAAT ATCATATAAT AAAGCAATAA AACAATACAT TTGAATATAT TTTTAAATGT 720
ATAAATAAAT ACACAAATGT ATAACTACTT TTTTAATTAA TGTTTTTAAA CACTGATTTA 780
TCAAAGAGTA AAAAAGTATA TTAATAAATA ATTTTAAATG CACATTTTAG TGTTTAGTGC 840
ATTTAAAAAA ATAATAATTT AAAGCCTTCT TTACAGTCCA AAATATGATT TGTTATATAC 900
ATCTGAGAGA TCCTGCAAGT AAACATCTGA ACTTATGCAG CTACACCATG CAGTATATAT 960
TTAAGTCTAA ATATGCATGT GTTTCTGAGC AATTGCACAG CTAATAGGGA GTCATATATG 1020
TGTAAAGTGT AATCATAAAA ATGTATGCAT CTTTCTATTT AACTATGCAT TTTGTTAGTG 1080
TGACTCTGTT TCCCCCTGCT GGTAGACATT AGTTACTTCA CCATGCTTAA TTTCTACTTA 1140
AAGGGATAGT TCTTTTAGGA ATGAAAATGT ACTCCCTTAA TTAAATTAAG TACATTTTAT 1200
TTACTCTCCC TCAAGTGGTT TTAAATCAGG GGTGTGAAAC TCCTGGAGGG CCGCAGCCCA 1260
GCACAGTTTA GTTCCAAACC T 1281