EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-25441 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr19:47404279-47406733 
TF binding sites/motifs
Number: 25             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr19:47405118-47405129GTTTTATGGCA-6.14
FOXB1MA0845.1chr19:47406106-47406117ATGTTTACATA-6.14
FOXC1MA0032.2chr19:47406106-47406117ATGTTTACATA-6.32
FOXK2MA1103.1chr19:47406105-47406116CATGTTTACAT-6.14
Foxd3MA0041.1chr19:47405165-47405177GTTTGTTTGTTT+6.32
IRF1MA0050.2chr19:47406414-47406435TGCTACTTTCACTTTTCATAG+6.13
Lhx3MA0135.1chr19:47406701-47406714TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr19:47406704-47406717TAATTAATTATTT+6.71
POU3F1MA0786.1chr19:47406063-47406075TTATGCTAATTT+6.37
POU3F2MA0787.1chr19:47406063-47406075TTATGCTAATTT+6.22
POU3F3MA0788.1chr19:47406062-47406075TTTATGCTAATTT+6.87
POU4F1MA0790.1chr19:47405675-47405689CATTAATTATTCAT-8.42
POU4F2MA0683.1chr19:47405673-47405689ATCATTAATTATTCAT-7.84
POU4F3MA0791.1chr19:47405673-47405689ATCATTAATTATTCAT-8.35
POU6F1MA0628.1chr19:47406702-47406712ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:47406702-47406712ATTAATTAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr19:47404835-47404846AAAACAAAGGA+6.32
Sox3MA0514.1chr19:47404835-47404845AAAACAAAGG-6.02
ZNF384MA1125.1chr19:47404628-47404640AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr19:47404629-47404641AAAAAAAAAAAA+6.22
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ZNF384MA1125.1chr19:47404625-47404637TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
ATGTTTAAGA TGATATGTTA AACCGAAATC CTGACTCTGT GTTTTTCAAA AAAAGCCAGC 60
ATCCTGGCCA AATCTGCCCA CTAGCCTCTG TCCATCATGG CCTCCTATCC CTCCCTATAT 120
CATAATAGGC TTCATCTCTG TGTCTCCTCT CCACCACTCA GCTGTGGTGT GTGTTCTGGG 180
CATTGCTTTA TCCAAGTGGA TGCTGCCCAG TGGTGGTGGA TAAGGAGATT CCCCCCAATG 240
TGTAAAGCGC TTTGAGTGTC TAGAAATGCG CTATATAAAA GGAATTCTAT ATATATATTA 300
TCCAGAATAA CTCAAATAAC AAGAACATTT TATTAATCGT GACACCTTTA AAAAAAAAAA 360
AAAACACCTA CATAAGATCT GAAGTAAGCG TATAGACTTT TGGAAGGTCA TTCTGAGGGT 420
CAACAGGCAA TATTAAATAT GCTCCAATAA ATGATGTCAA ACAATCTGTA CATCAACGGT 480
CAGAGAGCGC AAAGAGAGTC TGTCAAACAT CACCGATGCT CAAACATGAA CCAGATCAGA 540
TCCTGCCAGA GGAAACAAAA CAAAGGATAC ACATCATCTT TTCCAGGGAG GGAGGTTTGG 600
ATCTGAGCTC CAGCGCTGTA GAAGCATCAA TCTCCAACAG GAAAACAGGA CATGATTGAT 660
GGAAACATGA GGGAGATCCT GCGGTGAGAT GTTCTGACCC ATTCAGAGCA AATCGAGCGC 720
CAAGAAGCAG GTAAAAACAT CTTGTTCAGA GCTGCAGTAC AGGCGCAGGT TTACTTCAAT 780
GCTCAGGTGT GAGCGCAGCT TGACTGCAGA GTACATGTGA AGATCACACT GAATTAAGAG 840
TTTTATGGCA GCCTCGTATG AAGATGAATG AGCATCAGAG TTCACTGTTT GTTTGTTTGT 900
CTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTACCT GCATGCAGTG GCGCAAAAAG 960
GGGGTATGCA GTATATGCGG CGCATAGGGG CGCCACACAT GGGGGGGCGC CATTGTGCCA 1020
AAACTATTTT AAAATTTTTT CTTATAATTA TATATTTTTT ATACATATAA ATACATATTT 1080
TGATTAAAAA TATTTATCCT GCATTTTATA TAAATATACA ATTGTATTTT ATTGAATAAA 1140
AAAATTATAC CACCCCTCCG TCTTCTTTGA CCATTTGATT GATCCGTTGC TCGGTTACAG 1200
TCACATGTTC AAAATGGAGA GAAGAGTAAA GAGACGTGGA GCGCGAAATA GAAAACAAAA 1260
AGAGAACGAA CAATGCCTTA AAATGAAAAC TGCCATGACA AATTGGATAA TAAGGGATTG 1320
GTAAGCTTAA CCCACACTAT TATTACCATA CGTTTAATCA ACTTCTAATG TTTTTGGGAG 1380
CGACGGGCAG CCATATCATT AATTATTCAT TATCGCCACT CAGTCACTGC ATGCATGGGC 1440
TTTTACTTAA AATAAATCCA GACGAGGTGG TTTTGTCCAG GCAGGGGGAC AGTGACGCAC 1500
GGCCACACCT AACTGCGTCC GAAATCGCAT ATTTGCATCC TGTGTAGTAT GCGAAAAACA 1560
CTATAATTCT ATAGGCTAAA GCCATGATGA GCTGGTGTAA AGTTAACTTT ATGGTAAACG 1620
CTTTTGATAG TAGTAGATTT ATGGACCGTC AACTTCAAAA GAGATAATTT TTTATTTACT 1680
GCATTACAAA AGAGCAACAA ATGAATTTGG TTTGATCCTC TGTTTTGTTT GATAACAGAG 1740
GTGCGAGTCT GACTTTAAGA ATGCAATGAA AACATTTGTT TTGTTTATGC TAATTTAAGA 1800
TAATATTACT TGTGTTTCAA ATAAAACATG TTTACATATT ATTGTGTATT TGTCTATTTA 1860
CACACCTGAA TCTTAAAGTA TGCGCTTTCA TTCATCTTCA AGTCGCGTGT ATAGAAGCCG 1920
TCTTTATCAC TATGGGGTGC GTCCTTCACT CAGTACCGTT ATATGGATTC AGGGGCTGCA 1980
TAAGGGCGGC AATAGACGCA CAAAGCTTTA CTAGAAAGGA CGTGAACGCT GCCGTTTTTT 2040
ACATTAATTT TAACGTGCTG TCAATCCAAA ATAATGTGAA AGCTTAATTC TCTTAAACAG 2100
TTCTTGCATC ACATTTGAGA TCGGCTCTGT GTAGCTGCTA CTTTCACTTT TCATAGAAAC 2160
ATTACAAATG CGGGAGAAAT ACAGGAAAAA CACACACGGA AGAGCGGATA GAATGATAAA 2220
ATATGGTAGA TTTAATTTGG CAAAAACGAG AGGGTTTATA GGTATGAATT GCATACGTTG 2280
GCACACACAT TTTAATTCAT AATAATTGAA AACAATAACA TGCAGTCACA CATCCGTGTG 2340
TAAAGTTCAT GTAAAAGTTT TATCAAAATA AACGGTGAAA TCATACTTAC AGTTGAGTAA 2400
TCTGAAAAAT TTTCTTTATT ATTATTAATT AATTATTTTG CAAAAATAAG AGGG 2454