EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-25202 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr19:41761168-41763260 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr19:41762945-41762955GTCACGTGAT-6.02
ELF3MA0640.1chr19:41762838-41762851CTACTTCCGGCTA-6.25
HAND2MA1492.1chr19:41763034-41763044AACACCTGCA+6.02
IKZF1MA1508.1chr19:41761181-41761193GAAACAGGAAAT+6.37
Lhx3MA0135.1chr19:41762599-41762612GGTAAATTAATTT-6.07
MITFMA0620.2chr19:41762941-41762959GTAGGTCACGTGATAATG+6.05
MITFMA0620.2chr19:41762941-41762959GTAGGTCACGTGATAATG-6.05
PPARGMA0066.1chr19:41761566-41761586CTAGGTCAATATGCCTCATT+6.12
SREBF2(var.2)MA0828.1chr19:41762945-41762955GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr19:41762945-41762955GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr19:41762945-41762955GTCACGTGAT-6.02
ZNF143MA0088.2chr19:41762881-41762897ATCCCATGATGCACTG+6.7
Enhancer Sequence
AAATTAAATA AATGAAACAG GAAATGTGTT TTTTCATCAT TTTCGAGTTC CAAAAAACAA 60
AATGAATCCC GTCTTGGCCA CAAACACAAT ATCTGCGTGT TTCTCGCCGT TTCCAAAAAC 120
CCATCTGGTC CAAGTTAAGT TTAATATAAA AAGCTCATTC AGATATTGCA AGCGTCGAGG 180
TAGACTTGGC ACGGACGACC CCTTGCACCC ACTCTGCCCA CTCTCAGGTC TAGACGCTAT 240
ATTGGAAAAT GTCTTGCACG CTACAAATAC AAAAGGAATA CTGCTATTCT TCTTTACCTG 300
TTTTAGTGGG AATCGCTAGA CTGCACTGAG GTTACGTCAG CTAATGAGAA ACAAATGCTG 360
GCGTCGGAAT ATAACTCCAG TGTTTCATTA ATGACTAACT AGGTCAATAT GCCTCATTGT 420
GCTGCTGGAA ACGCTGCCCA GAACTGTGTG TCAATCTAGA CGAGACCGGG CACGGAATAT 480
AGCAAACAAG ACATTACATC GATCTGTGCT CTGTGGCAGT GAAGGGAAGT GCGTGACGGG 540
GACAGTATGA AAGCGAGCGT GTTTTGGTGT ACGTGGGGGG GCAAAGTGGA TCAGAGAGAA 600
ATTAGACAGC AGTCAAACTC ACCAGCAGAA ACTGAGTGAA CTCCCCGTAG TTCAGGTGCT 660
TCTTCCTGTC GGCGCCGAAG TGAAGCTGAA CAAATTCGGA GTTCCAGTTA AAGGGGATGT 720
GCTGGTGGAT TGTGGTCTGA GTGAAAACTT GTTTCACATC CTCTGAAATA AGAGATAAGC 780
CTGGTTTTAG AAATCTCATT GTTAGTGGAT TGAGTTACAA AACATGCATT GTGTGATTTT 840
TGATGATGGT ACCGTTCAAA ATAAAGGTAA ATATTTAGAA ATAAAGAGGT TTCAGATACA 900
CTGATTAGTT TACTTTAGCA AAACAAGTAC ATATGTAGCT TTTTAAAAAA GTGAACAAAC 960
CAGTCTTTTA ATTATTAAGT AAATGAACTA CATGCATACT TATAAAGATT AAGTTATTGA 1020
CTTAATTAAC AGTTCCAAGT TGCAATTGGT TTACTAATTT TTTAAATCAA CTTGTCATTT 1080
ATAAGGCAAT GGGTTTACTC ATTGTAAAGT AACAAATCAC TTTTTGTAGT GTACTATTTT 1140
GTATTTAAAC AGGAAAACAC ACACACACAA ATAATTATTA TTATCACTAT GTACTGCATT 1200
TTGATCAATG ACCAGATTGT AATATGGGGG TCGCCACTGG CTTGCTTGAT TTGGGATTTG 1260
GGACTTTGCT CTTCAGTGCT TGGATTTCAG CAGTGAAAAT TAAACCACAC TGAACTAAAC 1320
TAAACTGAAC TTAAACTCTG ATAACTGGAC GGACACAGTT TCAATTTACT AGAAATTCTA 1380
CTTTAGGCTG CTTTGACACA ATCTACATTT TAAAAGCGCT GTAGAAATAA AGGTAAATTA 1440
ATTTGTTTAA TTGACAAAAA TTTGATTTTA TATATAGAAA GCATTTCAAA TGCAAGTAAA 1500
AAGTCTAGTT TAATGTTTTG AACAACTTTT GTAAAACAAA ATTCAATGGC TGCATCTGAA 1560
ATCCCATACT TCCATAGTAT ATAGTACGCT AAAACAGTAT GCTAGCTGAG TAGTATCTCT 1620
GAATTCATAG ATTTCGAAAA ACGGTATGTA AGAAGTACCC TGATGACTTA CTACTTCCGG 1680
CTAGATTCTG AAGTGTCTGA TGCACGCTGT GCAATCCCAT GATGCACTGC AAGAGAATTC 1740
ATGAATGGGA GTGAAGCGAC ATAACTGATG AGGGTAGGTC ACGTGATAAT GACATGATGG 1800
TGGATATACT ACATCCGAGT TCCATTCATA CTACTCACAT TCATACTGTA TAGAACACAC 1860
TTTTATAACA CCTGCATTTA AATTCAAATG CAGTACCCAC TGAGTAGTAG GCAATTTCGA 1920
CACAGCCAAT GTCAAAAAGT AGGAATTAAT GCTTAAGATA CATTTATAAA ACAGCAACAA 1980
AAAAAATAAA ATGTACATAC TAATTTGAAT CTGTACACTG TAAAAAATGC AGGGTCCCCA 2040
CAATTCCTTA ATGTTGTCTC AACACAAACC AATAATGTTA ACTTAATTGT TT 2092