EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-24475 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr19:26269022-26270310 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr19:26269502-26269519TAAAAATAAACAAAACA+6.53
Lhx3MA0135.1chr19:26270067-26270080TAATTAATTAACC+6.98
MEOX1MA0661.1chr19:26269904-26269914GCTAATTAAC+6.02
NR2F1MA0017.2chr19:26270202-26270215CATTTGACCTCTG-6.25
Nr2f6MA0677.1chr19:26270199-26270213TGACATTTGACCTC-6.41
RXRBMA0855.1chr19:26270199-26270213TGACATTTGACCTC-6.35
RXRGMA0856.1chr19:26270199-26270213TGACATTTGACCTC-6.11
RxraMA0512.2chr19:26270199-26270213TGACATTTGACCTC-6.22
SOX21MA0866.1chr19:26270029-26270044AACAATAAAATTGTA-6.32
Enhancer Sequence
CCCTGCTAAA AAATCCAGCT TAAACCAGCC TAGGCTGGTT TAAGCTGGAT TTTTCAGCAG 60
GGACTACATC TCTACACTCC CTAGCAACCA TCAGATACTC TCTAGCAACC ACTTAACAGT 120
CAAACCTTTC TTTGAACACT GTATAAACCA CCCACAACAC TCTATAGTCA CCCTCCAGAA 180
CTCCTCTATT AAATACTAAC AACCAAGACC TTAGGAAACC CGATAGCCAC CATTTGCAAT 240
CCTCTAGCAA CTTATATAAA CACCCTAGCA ACAAATTAAA ACATACAATC CTGTAGCAAC 300
AACCTAACAA GCTTCTACAA GACTCTGTAG TGGCAAAACC AAACATATAT AATAAAATGT 360
ACAAATGAAC ACCCTAAATG ATGACATAGC AACCTTCCAC AGTAGCAATT TCGCAATATC 420
TTAGCAACCA ACTATACTGA AACGTAACCC TCAGAACAGT AATTACCCAA AGCTCTTTAG 480
TAAAAATAAA CAAAACAGCA CCTTAGGCAT CAAACAGGAA CCACCATAAA TACCCTATCA 540
ACCCCCCTAG CAATCACAAT CCATCATTGT GCTAGTGGAT TTGCACCATT ACCATTTTCT 600
TGAGAAACTG TAAGCATCTA GTTTGTTTCT CTCCCGCTCC ATCCCTCCCC CCTTTCTGCT 660
GCACTGGTCT TTTATGGTGC ACAGATGGTG CTCAGACTAC AAGCAGTAAG AGGGGTCTGG 720
AGGATCATGC TCTCTCATAT GCAGAGAAGT GACCTGTAAA TACCTGAGCC CACGCCTCGA 780
GTGTCGGTGT CTCTGCCCAG CCAGACCCTA TTAAAATATA CGAGGAGAGA GCCATCCGTC 840
CTGGCCGAGC TTTTAAATAC AAACATCCTG ATAGCTTAAT GGGCTAATTA ACTTGGATTT 900
CAGTTCCTCA ACAGCAGGTC ACAGTGGCAA GCACAAGGGT CGATAGCTTG TGCTGGCCGG 960
TGGAACGAGT GGGTTTCGGT TTAGAATGAA ATATGCAATA GCCACAGAAC AATAAAATTG 1020
TAGTTCAATA GGTGGAATTA GGAGGTAATT AATTAACCAT GTGTAGGAAT TTAATAGTAA 1080
AAAAGCTGCT TGATTAATAT GTGACTACAG ACTAATGACT GATCCTCTTT GGAATGATGG 1140
GATGTGGCAT TGCTAAAGAG CAGAGGGTCA CTGGCCATGA CATTTGACCT CTGGGTTTCA 1200
GCTTTGAAAA CACATAAACA ATGTGCTTCG GTATAAAGCT TTGCCGTTAG AATGCCTTGA 1260
ATTAAACTTT CACTGGACTC ATTCAGTC 1288