EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-24417 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr19:25123813-25125149 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr19:25124749-25124760ATATTAATTAT+6.02
BHLHE41MA0636.1chr19:25125052-25125062GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr19:25125083-25125093GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr19:25125052-25125062GTCACGTGAC-6.02
BHLHE41MA0636.1chr19:25125083-25125093GTCACGTGAC-6.02
CDX1MA0878.2chr19:25124601-25124612GGTCATAAAAC+6.02
CDX4MA1473.1chr19:25124601-25124612GGTCATAAAAC+6.02
CTCFMA0139.1chr19:25124304-25124323CGTTGACACCTAGTGGTCA-6
Foxq1MA0040.1chr19:25124563-25124574AATAAACAATA-6.62
MITFMA0620.2chr19:25125048-25125066TTTAGTCACGTGACCAGG+6.93
MITFMA0620.2chr19:25125048-25125066TTTAGTCACGTGACCAGG-6.93
MITFMA0620.2chr19:25125079-25125097TTTAGTCACGTGACCTGG+7.35
MITFMA0620.2chr19:25125079-25125097TTTAGTCACGTGACCTGG-7.35
NR2F2MA1111.1chr19:25124156-25124167TTTGACCTTTG-6.62
USF1MA0093.2chr19:25125052-25125063GTCACGTGACC+6.14
USF1MA0093.2chr19:25125083-25125094GTCACGTGACC+6.14
USF2MA0526.2chr19:25125048-25125064TTTAGTCACGTGACCA+6.02
USF2MA0526.2chr19:25125050-25125066TAGTCACGTGACCAGG-6.87
USF2MA0526.2chr19:25125081-25125097TAGTCACGTGACCTGG-6.91
Enhancer Sequence
TCCAACATTT TGAATTTGGG CCGCAATACA TAGTTCAATC ACTAGCTGTC AATCCTACAC 60
ACTGCACCTT TAAGATGTTC TTATATACAG TTGTCACTGT CACCAATGAT CCAGCCTGTG 120
CAGATCGCTT AAGAACTACA AATCTGCCAC TTTAATGAAC TACAAATGTC ATCATGCACT 180
TCACTCACAC ACCTGGCTCA GATTCCGCCT TGATAGCAAA CACACACAGC TGAAGCAGCT 240
CAGGACTAAT CAGATGGACT ATAAACACAG CACACACACA TCATTGCTGA GTCTTGTTAT 300
ACTATTTGTG AACATTATGA CACATTTGCC TTGCCTTGCT ATGTTTGACC TTTGCTTTGT 360
TTCTGTGTTT GTAGTTTACC GCCTGTACCG ACCAGTCGCC TGTTGTGGTG GGCAAAGCGA 420
GGCTTTACGA AACCCTGAAA CAGTCGAAGC AAATGTGTCG AAACTTTGAA TCGTTTCGAA 480
ACCCCACTCT ACGTTGACAC CTAGTGGTCA TTGTTTATGT ATTGCACTAG AACAGCTTCA 540
GCAAAGAACA GTTGAGCAAA TTTAGGTATT AAACCCCGCT TTGTATGATT TAACCTTCAA 600
GTGATTTAGT GGTGTGGATA AGGTTTCTGA CTACCATGCG GGGATAGTGG TTTTGAATCC 660
AGGCCGATAC AGCTATTTTG AAATGCTTTA ATATCACTTT GTAATGCTCT GTTCTTGTAT 720
TGTTTTGTTT CAATACTGGT CTGACATTCG AATAAACAAT ATGTGAAAAA AATTGTTTGT 780
CTTGTTTTGG TCATAAAACA AGGTTGTTGC TAGATCAGAC ATGGTTGTGG CCAGAAGTTA 840
ACAAGAATTA TTTATATTAT TCTTTAAATT TCCCATTTAT TGTATTTTAT TAACGTCTAC 900
ACAAACCCTA AACCCTACCA TTACAGTACT GCAAAAATAT TAATTATTGT TTTACAGTGT 960
TCCAAAAATG ATGCTAGATT GATGGCGTAT CCTCAGCTGC ATCCTATCTA GACTACACCA 1020
TAAAATAGTA ACATGATTAA AATACATAAA AGCATGACTT TGGAGTATTT GTACAAGTCG 1080
GGATTCGAAC CCAAAAGTCA TTTGAAGCAC AATAACAATG TGCACTTGCA CGGTCCACTA 1140
GGCTATATGA CAAACGTTTT TTTCTGATCA TGTCAGTCAA ATGCAGATTC GCCAGGTCTT 1200
GAAATGCTTC TAAACTGATT GTTGCTTTGA ACTGCTTTAG TCACGTGACC AGGTGTTTCG 1260
AAACACTTTA GTCACGTGAC CTGGGTGCTT CGGATCATGA TTCATGCAGT GTTTTGAAAC 1320
ACTTGCGCTT TGGGAT 1336