EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-24136 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr19:18697947-18698901 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr19:18698834-18698851TAATTGTAAACAAACAT+6.09
NR2C2MA0504.1chr19:18698158-18698173TTGGGTCAGAGGTCA+6.32
NR2F1MA0017.2chr19:18698164-18698177CAGAGGTCAAAAG+6.59
Nr2f6MA0677.1chr19:18698159-18698173TGGGTCAGAGGTCA+6.37
POU3F3MA0788.1chr19:18698261-18698274AATATGCTAATGT+6.12
RXRBMA0855.1chr19:18698159-18698173TGGGTCAGAGGTCA+6.19
RXRGMA0856.1chr19:18698159-18698173TGGGTCAGAGGTCA+6.28
RxraMA0512.2chr19:18698159-18698173TGGGTCAGAGGTCA+6.12
Sox11MA0869.1chr19:18698283-18698298AACACTGAAATCGTC-6
Enhancer Sequence
CTGAATGAAA ATGTTTTGTA ATATTCACTA TTTGGTTTGG ATCAATTGAA AATTTATAAT 60
TTAAGGCAAA AAAAAAACAA AAACATAAAT GTAAATCTGT CATTGGGTTT GAAGTAAAAC 120
AGTTATTTTG TGTTCAAGTA GCAGATGAAG ACAAAGAGAC AGAATGTCTA TGTGTGGAAA 180
TAAGGGGCAC CGTTAAGTGG AGCTCTATGC TTTGGGTCAG AGGTCAAAAG TTGTTTCTCC 240
AGCCCTTGCC TTGGGCTGAG GGGGAAGGAC CAGTAATGAC TGACAGATGT TTTATCGTTG 300
GGGGTGGAAT TTGTAATATG CTAATGTTTT TCTTAAAACA CTGAAATCGT CAGACACACA 360
CACAATATTC CAGCATTCTC GAATATCATC CGGTCCTATA GCAGTCGTGT CAGCTCTATT 420
GTTTCTGAAT GCCCTGACAA GCACATGTGA CTTATATTTT AACAAGGTCC ATGAAAATAC 480
GTACTCAAGC CATCAGCAAG TAGCTGCATG AGAATATCCA GATGCTGAGA AATCACTTTA 540
TGCTCATTTT ACAGTTGAAC CTAAGCAAAG AAACCCACAG CCATTTAAAC CCAGTGCCAA 600
AGCGAAAAAG AAAACATAAT GTGTGTGGAT ATACATAAAA CTGACAACGA TTTTATTAGA 660
CCAAAGAGTC TTCAAAATCT TAATTTAAAT TACACTTAAG AAATGAATAG TTTTATTTAG 720
CATAGTCAAA TTAAATTGAA GAGTGTCAGT AACAAAATAT ATTTGTAATT TTAGAAATAA 780
AATCCAGTTT AAATGCATGT TTATGTGTTT ATGAAAAAAT CCTGAAAAAT GTATAATGCT 840
TGAGCAAAAC AAAACAAGAA CAAAAAACAG CAGTATAATG GTAGCGGTAA TTGTAAACAA 900
ACATGCTTTT GAACAGCAAA TCAGCATTTT AAATGGCATT CATATGTTAA TTTA 954