EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-23747 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr19:6961841-6962902 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hmx2MA0897.1chr19:6962018-6962035ACGACCAATTAAATCAT+6.26
Hmx3MA0898.1chr19:6962018-6962035ACGACCAATTAAATCAT+6.22
Hoxa11MA0911.1chr19:6962012-6962024AATTTAACGACC-6.32
Enhancer Sequence
CTTCAAATGA AGCCACAGCC ATTTCTCATG CTGAAATGGA GTGAAACTGG CATCAGCTCG 60
CAAAAAAATG CTGAATGAAT TACAAGCGGG GTAATGTGAC GGTAATGAGT GGTCTTGTTT 120
CAGTCTTTTA AATCGCTGAC TCAGTCAGAT GATTCAGAAT AGCACTGAAC CAATTTAACG 180
ACCAATTAAA TCATCTTTCA TAAAAAATTC CGTCAGTATA AAGGCGAAAG TCACCGTGGC 240
GTTCAGAATA TCCGTGTTTT TGTGTCGTGA GGGCGCGATT GTTTAGCCGC CTTTTCCTTC 300
GCTATTAACC ATATAGAGGC CCGCTGATGC GACAAGGGTG TGCCGCACTC CTCTGCTGGA 360
CCTGTCCCGT TAAAACGACC CATTTAGCAA AGTGAGGATT CCTATTCACA CATATCACCA 420
TTCATTCGTG TTCTCTTACG CAACACATTA GCGTCAACAA GCACAAAAAT GAGAACACGC 480
CAGATAAAAA CGTGCTGTCT CATTTAGTAA GACAATGAAC AGACATCCTA ATACCGTAAT 540
GAAAAACGAC TGTCGGTTCT GTTACGTAAA TCAAGCGGTG CGTCGTGAAA CATTGCGTTT 600
TTATTCCGCT TCAGCAGCGC TCGGCACACT GGCGTTAATA AAGTCAGCCC CTGAGAGCTG 660
TATGTCATGG CCAGAGACAG TATTTGATGT CCCATTCAGG AGGAAGCTGC ATCATTCGAC 720
AATGAACTAT GAATCAATAT TTTCTCGTGT TACCACTTCG ATTTCCCTGA CAGGGTATAG 780
CCTACAACCA AGGTGCAGGA TTCATTAACA ATTTGATTTA AAACAAGCAA GTATTTCGAG 840
CATTGGATAT TTCGTGCCCA TATAGCCTAA TTTGTCAAAT CTGCACGTGA ATGTGAGATT 900
GTAGGCTAAT TGTTTGACAT CTCTTTGCAG TAGCCTATTT AATAAATAAG ACAATGCTGT 960
TAAAATTTTT AAGATGTCCC GACGCGAACT GTTTCTTGCC TTGGAACGCC CCAAATCCTT 1020
TGTTAATAAT CCTGTATTAG AATATAAAGT TAAAAGGAGC G 1061