EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-23487 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr19:2134545-2135401 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr19:2135280-2135291GTTTTATTGCC-6.32
CDX4MA1473.1chr19:2135280-2135291GTTTTATTGCC-6.62
FOXC2MA0846.1chr19:2135384-2135396TTTGTTTACATT-6.37
FOXK2MA1103.1chr19:2135384-2135395TTTGTTTACAT-6.32
FOXP2MA0593.1chr19:2135384-2135395TTTGTTTACAT-6.14
Foxj3MA0851.1chr19:2135381-2135398TAGTTTGTTTACATTTG-7.07
HOXD9MA0913.2chr19:2135280-2135290GTTTTATTGC-6.02
NR2C2MA0504.1chr19:2134647-2134662TGACCTCTGACCTGT-7.58
Nr2f6MA0677.1chr19:2134647-2134661TGACCTCTGACCTG-6.67
RXRBMA0855.1chr19:2134647-2134661TGACCTCTGACCTG-6.1
RXRGMA0856.1chr19:2134647-2134661TGACCTCTGACCTG-6.38
RxraMA0512.2chr19:2134647-2134661TGACCTCTGACCTG-6.27
Enhancer Sequence
CCTGTTATGT CATGTCAAGA ATAACATGTA AAAGTCTGGC AACTCATCTC AAAGCTGTTA 60
TTTAACCTCT GTGATTCATT CCTCAAGCAC AAACCTTTTC CCTGACCTCT GACCTGTTGA 120
ACGGCTCCGC ACACAGCAGA TCATTCATGA CTAGTGCTGA CAGGCCATGG ATTTGGTCAA 180
ACAGCAAAAC AAACTCACTC TGGATGCTGC TGCTGCATTC TAGAGACTGC TCTACACCAC 240
AGACACAATG CATATGTGTG TTATTAAAGA GATGAACAAA CAGGCTTTCA CACAAGTGGC 300
GTGTCACAGG ACAGCATCAG CTGCCAGCAA ACTATTCCAG CTAAAACATC AGCCTTTACA 360
CACAGAGTTA AAGGGGCAGT TCACCCAAAA ATTTGGGATC TGTCATCATT TACTCATCCT 420
TTACTTGTTT ATATGTTAAA CACAAATGAA GATATTAAGA AAAATGCTGA AAATCGGTAA 480
CCATTGACTT CCATGGTATT TGTTTTTCCT ACTATAGAAG TCAATAGTTA CAGGTTTTCA 540
GCTCACCAAA ATATCTTCTT TAGTGTTCAA CAGAATAAGG AAACTCATAA AAGTTTGAAA 600
GCACATGAGG GTGAGTAAAT AGTAAGTAAA TTTTACTTTT TGGGTGAGCT TTCTCTTTAA 660
GTCAGAACAT CCACATTTAA ATGTGAACAC CCTAAATTAT AATTTAGGTT GCAAACGAAA 720
CAGTAAATTT ACTGTGTTTT ATTGCCATTT ACATTCTCCA TATTCATTTT TGAGCAGTTT 780
ATTATTACAG GATTAAACCC TTGCTTTGCT ATTTGAATTA AACCCTAGAC ATGTTGTAGT 840
TTGTTTACAT TTGAAA 856