EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-23113 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr18:46259474-46260630 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr18:46259714-46259733TACTGCCCCCTGCTGTAAA-6.17
CTCFLMA1102.1chr18:46259715-46259729ACTGCCCCCTGCTG-6.83
SOX8MA0868.2chr18:46259758-46259768AGAACAATGG+6.02
Enhancer Sequence
GTCTGCTCAA AAATAAGTGT ACGTTAAGGC GCAACAACGT ATTAATAAAA TGTAGTCTGA 60
TAATAAATGG ACCGATTTGG CCTAAATTGG TGTAAACTGC ACTAATGTGA CATTGATACG 120
AAGTGTTGAT GAAGGCACAT TTAACCAAGT GTACATTCAA AGGTTACATC CTAACAAAAA 180
TGTCAATGCG TTACTTTTAA CTTTATGAAG CAGGTCTGAA GGTCAGATTT GAGGTTTACA 240
TACTGCCCCC TGCTGTAAAT GTATAGGCCT ATACGTCGGA CAAAAGAACA ATGGTCATGA 300
ATAAACCGTT TCCCTCCGAA ACATTAGAAA TACCTGTAGA AAACAAATCA CTTAACTTAC 360
TAATTTTATT CTGACATTAA AAATGGACTG CTTAAAATGA ATTACGCGTT ATTTATCGTT 420
CAAGTTCAGT GAAAACCAAC AAGTGTCTAA TGGCTAAAAT CCAGGAGGTT AACGTTAACA 480
TTTCCGTGAC AGTGTAACGT TACCATTTCT CTCTCTCTCT TTCTCATTGT ATTAATTTAA 540
TGTATTCATT TATTAGACTC GAACACTTGA TTCACTTGAA ATATTTAAAA TGAAAAAGCG 600
ACGATGTATT TTCATATTTC ATTGTAGATT GTACAAATCC TGACCAATAC TCGTCCATTG 660
CTTTTAGATT AAAGGAGATG AGCTATAAAC TCAGTTTATT CGAAAAGAAA TATAAGTTAT 720
GAGCCATCTT GTGATTTACA ATGTTTTAAA TTTGTAACGT TTTTTCTTTG GAAAAATCCA 780
AAGTTTCTCG TTTATCGGCT GTGTTCGACC AAGTGGACAT ATTTTGTGTG ATGAACTTTA 840
TAGGCGTCCA TATTAAATTC AGAAAAAAAC GTTTTCTGGT GAAATCTGTA ATTGTAAAAG 900
GAGAAAAGCC TCACTCACCG CCATCTTCAG CTCCTTGTTG CGCCAGGAAT CCAATTCTTC 960
CAACAGTGTT CCCACAAGCC ACGCCCTTCA TTCACTACTC TTTCAAGTTA TTGGTTAAAC 1020
AACGTGAACG ACATTTTAAC TCTCCAATCA CAGACTACAC ATTACTCATA CCAGCCAATT 1080
GTTCACAAGG AGGTGTGGCC TGGTGTAAAA ATAACGCGGA GAACACGGAC AGTGTTCATG 1140
AGAAATGCCC ATTTAT 1156