EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-22851 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr18:40451978-40452648 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr18:40452171-40452188ATTAATTAATTAATTCA-7.27
ArxMA0874.1chr18:40452172-40452189TTAATTAATTAATTCAT-6.04
ArxMA0874.1chr18:40452171-40452188ATTAATTAATTAATTCA+6.7
Lhx3MA0135.1chr18:40452166-40452179TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr18:40452174-40452187AATTAATTAATTC-6.29
Lhx3MA0135.1chr18:40452169-40452182TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr18:40452173-40452186TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr18:40452170-40452183AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr18:40452167-40452177ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:40452171-40452181ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:40452175-40452185ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:40452167-40452177ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr18:40452171-40452181ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr18:40452175-40452185ATTAATTAAT-6.02
ZNF24MA1124.1chr18:40452182-40452195AATTCATTCATTT+6.32
ZNF384MA1125.1chr18:40452439-40452451TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr18:40452440-40452452TTTTTTTTTTAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr18:40452441-40452453TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
TCGAGAACCA GACAGAACAA ATGTATGAAA TAGTTATTAG TAAAAAGAAC AAGTCTATTT 60
AAATGCACTT TATTTGTTAT GTTATATATA TTTTTGTCCT GGTTTGGTTT AAAACTCTAT 120
GGAAATATGC AGATTTAATG TAATTATAAC AAACTATTCT AATTACAATT AAAAGTACCT 180
TTATTTATTA TTAATTAATT AATTAATTCA TTCATTTATC TTTTTTTTTT ACTTGGCTGG 240
TAGCAATGAA TAATCAGCCA AAAACAGTTA ATAAATTAAC ATCTAAAAAT CTACAAAAAT 300
CTAATTTATA ATTTTAATTT ACAAATAAAC TCCAACAGTA ATCTAAAGTT AATAAGCAGA 360
AATATAGAAA GATATGCAGG GTATTTTGAG GATGATTGAA GGAGGAAGTA ATTCAGAGAT 420
GGGGCAGTGT TGTTACAGAG CAGTAATTAT AGACTGGGTA CTTTTTTTTT TTAAATAGGC 480
CTAAGCCTCC TGTGGTTTTC GCCACTTCTT ACCTTCTCAC AGAATAATGG AGAAAGGGCT 540
AAAGAGAGTG TGTGTAGATG TAAAAGGACA GCGACCCCCT GTGCTGAGGT AATTACTGCC 600
CCTCTCTCTG AGTGCTCTGG TGGAACATTC ATTATGCCTA TCCTCTCATG CAAACACACA 660
CGAACTCTAT 670