EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-22332 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr18:25669387-25670400 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr18:25670232-25670248ATGTGTTTACTCAAGG-6.04
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr18:25669880-25669895GGGGTCAAGAGGTCA+8.07
RarbMA0857.1chr18:25669879-25669895TGGGGTCAAGAGGTCA+7.22
RargMA0859.1chr18:25669880-25669896GGGGTCAAGAGGTCAC+7.53
SOX15MA1152.1chr18:25669761-25669771CTATTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
TGGAAAATCA TGTGGGTGTT TAGAGTATGA CAGAATTTTA GATTTTGGAT TAGCTAAACC 60
AGAAAGATCT TCATGGTCAA CCATTTACTC ACAAAGGTTT TGTTCACACT TGGCAAGTTT 120
GGTTTGTTCC TGATGCAAAC AACATGTGGA CTGGGATCAC TTAAAAAAGA TGTATTTTTC 180
CATTCGAAAT GTGGTGTAGT TAAACCAAAA AATAAGCAAA ACACTAACCA AAGATCTAAA 240
CAAACCAAAA TCAGGACATG ATGTCACAAA GTGTGATCAT AAAAATGACA GAATAGCCAA 300
AAAAGGACCA AACAAACCAA AATAAACAAA CTACGAGTTT GAACACACCC CAAGAACATC 360
CCTTAGGTCT GACGCTATTG TTTTAGGCTC TTGCTGATTT CTTTCACCTC CTCTGTTTTC 420
CTGCTTCTAG ATGACTGTCT GCTAAAGAAA AAAGTGTTAC AGGCCGGTCC CGAGAATGCC 480
CTGACCCCGG CTTGGGGTCA AGAGGTCACA CTGAAAATGC AGGGTGTGCT TGAGGACAGG 540
ACTGTGGTGG AGAAAGACAG TAAACTGGTC TTCATTATTG GAGAGGGAGA TGTCACCCAG 600
GTGAGACACA CAGGCTAGCA GAGGAGGGGC TGCCACACAC ACACACACAC ACAGACACAC 660
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 720
ACACACACAC ACACACACAC AAGAAGCCCT AGAACACCTG CCTGCATTCT GCCTGTCACC 780
TTGCACCTGC TGCCTACCGA GTTTTCCATA GGGATTAACC TGTGTTTTCA CATGTTGGGT 840
TCTGTATGTG TTTACTCAAG GCTGGGAAAA CGTCAGCTCC TTGCTGATTC ACATCGCAGT 900
GGAAAGTTAG TGAGGCTAAA CTAGTTTGCC AACTTGTTTA ACGCTTTGAA GGATTGGTTC 960
ACCCTAAAAT GACTCTACTG TCATCACATA CTCACTCTTA TGTTGTTGCA AAC 1013