EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-21195 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr18:4395747-4397499 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr18:4396160-4396170ATCACGTGAC+6.02
CUX1MA0754.1chr18:4396494-4396504TTATCGATTA-6.02
CUX2MA0755.1chr18:4396494-4396504TTATCGATTA-6.02
HNF1AMA0046.2chr18:4396407-4396422AGTTAATGATTAATC+6.31
HNF1AMA0046.2chr18:4396407-4396422AGTTAATGATTAATC-7.58
HNF1BMA0153.2chr18:4396408-4396421GTTAATGATTAAT-6.02
HNF1BMA0153.2chr18:4396408-4396421GTTAATGATTAAT+7.34
LMX1BMA0703.2chr18:4395866-4395877ATTTTAATTAA+6.62
Nkx3-2MA0122.3chr18:4395927-4395940TTAAACACTTAAA+6.37
ONECUT1MA0679.1chr18:4396493-4396507ATTATCGATTATTA-6.17
ONECUT2MA0756.1chr18:4396493-4396507ATTATCGATTATTA-6.32
ONECUT3MA0757.1chr18:4396493-4396507ATTATCGATTATTA-6.05
SREBF2(var.2)MA0828.1chr18:4396160-4396170ATCACGTGAC+6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr18:4396160-4396170ATCACGTGAC+6.02
TFEBMA0692.1chr18:4396160-4396170ATCACGTGAC+6.02
Enhancer Sequence
TTTAATGGGA TGTAATAGCT AATGATAATA ATGATAATAA GTTAACACAT TTGTTTAGAA 60
AAAGATATAT TGAAACTCTC TCGTCATTAC CAAAACTGCA TTTATTTGAT CAGAAATGCA 120
TTTTAATTAA TTTATATTTT TAAAGTATAA TTCCTGTGCT TTCAATGATA ATTAAATATG 180
TTAAACACTT AAAAATAAAG GAACATAAAA TACAGTTTTG ATGTGGAACT GTGGCTCTGT 240
GGTTAACACT GTTGCCTCAC AGCAAGAAGG TCGCTGGTTT GAGGCCCCGT TTACACTAGT 300
GCGTTTTAGT TTTAAAACGG CGTTGTAGAA TGAAAACGAT CCGCGTCCAC ACTCGCGTTT 360
TACCCAGCGT TTCTGAACAG CTCTCCGTCC ACACCAAAAC GCTGAAAACG CACATCACGT 420
GACCACACAC ACACTCTCGG GCAAGCGCTC CAGCTTTTTA ACCCAGATGA GAGCTCTGCT 480
TGTCGGACTG CTTATCACGC ATCTCCCGCT GGATCTAATC TCACTATATT TGCTAAACGT 540
GATATTTCAT TCATGTTGTT GTCTTTATCT AACGACATAG GCTAATTCCC TGACGTTGGT 600
CATTGGAATC TATTAAGTTA CTTGTTCACA GGTAACATGT TTTGGTTAAG CGCAAAGATA 660
AGTTAATGAT TAATCCAGGT ACATTGACTG ATCGCTTGCC TTTATTTCCT ACAATGTATA 720
AACTTATTGT ATGTTATACT TTTATAATTA TCGATTATTA AAACTGATAT TCAGCAAAAG 780
AGAGGGTGCG TTTCGTATTT TCACTGAAAT TGAAAGGAGG CAGGTGTTAT CGGCTCCGTT 840
TAGTTATAAA TATGCACACA GTGAAGATGA CGCTTATATA TGCAGCACGG CGCCTCAACA 900
TTTCTGCTGT CTGTTAAGTT GCTAATATTA AAAAGAAAAT AGGCAGTTCC TTAAATCATG 960
TTTACGTTTT ATTGTTGAGA AAGTGAAACA ACGTAGCGAA GGTGATGTGA ATGAAGTTAT 1020
AATGTACACT GTTTCCTGTG AAGATTTACC CGTGTCCTCG GTATGTTTTC CATATCAAAC 1080
TGAGAAGGGG GAGACTGCAG CCTTGATCAA AACTTGCGAA GTCTTAACTT GCAAGAAGAG 1140
GATGCGAGAC TGAACTGTGT GTGGGCTACT TAATATTCAG GAAAAGCCCC AATCAGAGAG 1200
GCGAACGTTT GCAGCCCCGC CTCCGTTTTC AGATGTCTCC GTCTTTCCCC ATCCACACTG 1260
AGACGGAGCA GCAGCGTTTT AAAATGAAAA CGGCCTCTCC AGCGTTTTCA AAAAGCTCAG 1320
TTTTCGGCGC TCGAGAACTC CGGCGTAGTG TGGACGGATG GCGTAACCGT AGCAAAACTT 1380
ATGCGTTTTC AAACTAAAAC GCACTAGTGT AAACGGGGCC TGAGTCCCGG CTGGGCTAGT 1440
TGGCATTCTG TGTGGAGTTT GCATGTTCTC CCCGTTGCCG TGGGTTTCCT CCGGGTGCTC 1500
CGGTTTACCC CATAAGTCCA AAGGCATGCA CTATAGGGGA ACTAAATTGT CCGTAATGTA 1560
TAAATGTGTG TGAATGATTG TGTATGGGTG TTTCCCAGTA CTGGGTTGTG GTTGGAAGGG 1620
AATTTGCTGC GTATAACAAA TGCTGGAATA GTTAACTGTT CATTCTGCTG TGGCGAACCC 1680
TGATAAATAA GGGACTAAGC TAAAGGAAAT TGAATTAAAT ATATTTTTGG CCAAGCACAC 1740
AAAATACAAT TT 1752