EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-21102 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr18:740635-741729 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr18:740903-740914AACCACTCAAG+6.32
POU4F1MA0790.1chr18:741306-741320AATTAATAATGCAG-6.35
POU4F2MA0683.1chr18:741304-741320TTAATTAATAATGCAG-6.67
POU4F3MA0791.1chr18:741304-741320TTAATTAATAATGCAG-6.75
PRDM1MA0508.2chr18:741338-741348TCACTTTCAC+6.02
RREB1MA0073.1chr18:740974-740994CCCCAACACACACACACACA+7.29
Enhancer Sequence
TGTTTATTTG AGCAGCGAGT ATCACAGTGT GCGTGTGTGT CTGGAAAAAC CCCGTCTGTA 60
ATCCAGTGCA AATAGTTGCC TTCAGTCCCA CCTGCGGACC CACCCGGAGT CACCAGACAG 120
AGCGGAAAAC ACATGGGATT ATCCAGTAAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 180
ACACACACAC ACACACACAC GTACTGACTA TGGCACTACT GAATGTGTGT GACCTGAGGA 240
AGTGTTCAGA AACATCTAAA CACCCACCAA CCACTCAAGT TGATCCAGAA GCAGTTCAGT 300
AGATTCCCTT AAACAGCAGA GAGCATTCCA CTGACCCTCC CCCAACACAC ACACACACAC 360
ACAGTCTTAC AGACATGCAG ACACACAGAG ATAGACATGC ATGCACACAG ACGCTCATAG 420
ACACATAGAC ATACCCATAC ATTCACAGAT GCACACACAC ACACACTCAA AGACACGCAT 480
ATACACACAT TTGTCACAGA GACATGTACT TGCTCACACA CAGACGCATT GCAAACTCAC 540
ACACAGACAA GTAAGCATGT ATTGCACACA TACACATGCA CACATAGGCA AGCACACACA 600
CACACACACA CACACACACA CGTCTCATCC TTAATCCTCA TGCTACAGAA TTTCATTAGT 660
TTTGAGCATT TAATTAATAA TGCAGCATTA TTAATAACCC TCATCACTTT CACTTGCAAC 720
ACCACGGTCA AGGGTTCGAT TTCCAAGGAA TGCATGAAAG TGTGATGAGA TAAGATCCTC 780
CACACACACA CGCACAAATG CACATGTCAT ATTCATGTCA TATTGTTCAG CCTTTTCACT 840
TGTACTCGTG CAAAACGCAA ACAAGATGTG GTTTAGTGAG GGACGCAACA GCAGGAACGC 900
TCCGGATCAT TTGAAGAGTC TCTCAGTCAA ACTGCAGTAA ACACTGCAAC ACAGAACTGA 960
TATATTTACT CACAGTTTGA GTCTCGTTTC TAGTCCAAAT GTCTAAAAAC TCCTAAATCA 1020
AGAAGCAAAT GTAGGTAAAT GTAGTCTGGT TTCGGGGGGT TTGGGTGGCT CGACGCCCCC 1080
AATGTTCAGA ATTT 1094