EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-20566 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr17:40002414-40004630 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFLMA1102.1chr17:40002750-40002764GGCCAGGGGGCACC+6.12
CTCFLMA1102.1chr17:40003856-40003870GGCCAGGGGGCACC+6.12
CTCFLMA1102.1chr17:40004224-40004238GGCCAGGGGGCACC+6.12
HESX1MA0894.1chr17:40002476-40002486GCCAATTAGC-6.02
LBX2MA0699.1chr17:40002476-40002486GCCAATTAGC+6.02
Enhancer Sequence
AGTCCAGGGA GAAAGGTGGA CCCCTGGATA GCTTGCTGGG ATCACAAGCC CCTAGGTGGA 60
GGGCCAATTA GCGCCCTGGG GCCTATACTG CTTGTCCAGG GAGAGAGGTG GACCCCTGGG 120
TAGCTTGCTG GGGTCAGAGG CCCCTAGGTG GAGGGCCACG GAGCACCCTG GGGCCTATCC 180
TGCAAGTCCA GTGAGAGATG TGGATCCTGG GTAGCTTGCT TTGGTCAGAG GCCCCTAGCT 240
GGAGGCCCAC GGCGCACCCT GGGGCCTATA CTGCAAGTCC AGGGAGAGAG GTGGACCCCT 300
GGGTAGCATG CTGGGGTCAG AGGCCCCTAG GTGGAGGGCC AGGGGGCACC CTGGGGCTTA 360
TCCTGCAAGT CCAGGCAGAG AGGTGGACCC CTGGGTAGCT TGCTGGGGTC AGAGGCCCCT 420
GTGTCAAGGG CCCTTGAGCC TCCTGGGACC TATACTGCAA GTCCAGGGAG AGATGTGGAC 480
CCCTGGGTAG CTTGCTGGGG TCAGAGGCCC CCATGTGGAG GGCCATTGAG CACCCTGGGG 540
CCTACACTGC AAGTCCAGGG AGAGAGGCGG ACCCCTGGGT AGCTTGCTGG GGTCAGAGCC 600
CCCTAGACGG AGGGCCATTG AGCACCCTGG GGCCTTTACT CCAAGTCCAG GGAGAGATGT 660
GGACCCCTGA GTAGCTTATA AGTGTCAGAG GCCACTATGT GGAGGGTCCA AGGGGCACCC 720
TGGGGCCTCT ACTGCAAGTC CAGGGAGAGA GGTGGACCCC TGGGTAGCTT GCTGGGGTCA 780
GAGGCCCCTA GATGGAGGGC CAAGGCGCAA TCTGTGGACT CTACTGCAAG TCCAGGGAGA 840
GAGGTGGACC CCTGGGTAGC TTGCTGGGGT CAGAGGCCCC TAGATGGAGG GCCAAGGGGC 900
ACTCTGTGGA CTCTACTGCA AGTCCAGGGA GAGAGGTGGA CCCCTGGGTA GCTTGCAGGG 960
GTCAAAGGCA TCTAGGTGGA GGGCCACGGA GCACCCTGGG GCCTAACCTG CAAGTCCAGG 1020
GAGAGAGGTG GACCCCTGAG TAGCTTATAA GTGTCAGAGG CCACTATGTG GAGGGTCCAG 1080
GGGGCACCCT GGGGCCTCTA CTGCAAGTCC AGGGAGAGAG GTGGACCCCT AGGTAGCTTG 1140
CTGGGGTCAG AGGCCCCTAG GTGGAGGACC TAAAGGCACC TTTGGGCCTA TACTGCAAGT 1200
CCAGGGAGAT TGGCGGACCT CTGGGTAGCT TGCTGGGGTC AGAGGCCCCT AGGTGGACGG 1260
CCATTGAGCA CCCTGGGGCC ATTACTGCAA GTCCAGGGAG AAAGGTGGAC CCCTGGATAG 1320
CTTGCTGAGA TAACAAGCCC CTATGTTGAG GGCAAATGAG CGCCCTGGGG CCTACACTGC 1380
AAGTCCAGGG AGAGAGGTGG ACCCCTGGGT AGCTTGCTGG GGTCAGAGGC CCCTAGTTGG 1440
AGGGCCAGGG GGCACCCTGG GGCCTATCCT GCTAGTCAAG GGAGAGAGGT GGACCTCTGG 1500
GTAGCTTGCT GGGGTCAGAG GCCCCCAGGT GTAAGGCCAC GGGAACTCTG GGGCCTCTAC 1560
TGCAAGTCCA GGGAGAGATG TGGACCCCTG AGTAGCTTGT AAGTGTCAGA GACCTCTATG 1620
TGGAGGGTCC AGGGGGCACC CTGGGGCCTC AACTGCAAGT CCAGGGAGAG AGGTGGACCC 1680
CTAGGTAGCT TGCTGGGGTC AGAGGCCCCT AGGTGGAGGA CCTAGGGGCA CCTTTGGGCC 1740
CATACTGCAA GTCCAGGGAG AATGGCGGAC CTCTGGGTAG CTTGCTGGGG TCAGAGGCCC 1800
CTAGTTGGAG GGCCAGGGGG CACCTTGGGG CCTATCCTGC AAGTCAAGGG AGAGAGGTGG 1860
ACCTCTGGGT AGCTTGCTGG GGTCAGAGGC CCCTATGTGG AAGGCCAATG AGCGCCCTGG 1920
GGCCTACACT GCAATTCCAG GGAGAGAGGT GGACCCCTGG GTAGCCTGCT GGGGTCAGAG 1980
GCCTCTAGGT AGAGGGCAAG GGGGCACCCT GGGGCCTATC CTGCAAGTCC AGGGAGAGAG 2040
GTGGACCCCT GGGTAGCTTG CTGGGGTCAG AGACCACTAT GTGGAGGGTC CAAGGGGCCC 2100
TGGGGCCTAT ACTTCTTGTC CAGGGAGAGA GGTGGACCTC TGGGTAGCTT GCTGGGGTCA 2160
GAGGCCCCTG TGTGGAGGGC CATTGAGCCT CCTGAGACCT CTACTGCAAG TCCAGG 2216